虽然运动疗法对营养过剩性脂肪肝患者可产生良好效果，但并非所有脂肪肝患者都适宜参加体育运动。因恶性营养不良、蛋白质－热量营养不足、胃肠外营养、甲状腺功能亢进和肺结核等慢性消耗性疾病，以及药物和毒物所致的脂肪肝患者，过多运动会成为代谢的干扰因素，不利于疾病的康复。妊娠急性脂肪肝、瑞氏（Reye）综合征等急性脂肪肝患者则应绝对卧床休息。
营养过剩性脂肪肝伴有并发症时，其运动疗法的适应证还处于累积经验阶段。但是如果脂肪肝患者合并下列疾病时应禁止运动：
①急性心肌梗死急性期；
②不稳定性心绞痛；
③充血性心力衰竭；
④严重的心律失常；
⑤重度高血压病；
⑥严重糖尿病；
⑦肾功能不全；
⑧严重脑血管疾病；
⑨肝功能明显损害或已发展至失代偿期肝硬化。
脂肪肝患者合并下列疾病时应尽量减少运动，并且运动需在医疗监护下进行：
①频发室性期前收缩和心房颤动；
②室壁瘤；
③肥厚梗阻性心肌病、扩张性心肌病和明显的心脏肥大；
④血糖控制不好的糖尿病，特别是常有低血糖发作者；
⑤甲状腺功能亢进；
⑥肝肾功能损害；
⑦应用洋地黄或β–受体阻滞剂等药物；
⑧严重肥胖或继发性肥胖。肥胖度70%以上的肥胖者可以先给予以药物减肥治疗，待体重减轻至肥胖度50%以下时，再开始运动疗法。
