与肥胖症等营养过剩性疾病一样，各种原因所致营养不良也可引起脂肪肝。常见的有由于饥饿和低蛋白饮食引起的脂肪肝。
1.饥饿 长期处于饥饿状态，因低血糖刺激交感神经功能亢进，加剧脂肪分解，过量脂肪酸进入血液，使血中游离脂肪酸增多而造成肝内脂肪蓄积。
2.低蛋白饮食 蛋白质摄入不足是引起脂肪肝的另一重要原因。长期蛋白质－热量摄入不足所致的营养不良称恶性营养不良症，好发于儿童。患儿长期以淀粉食物为主，由于蛋白质缺乏，白蛋白合成减少，血浆甘油三酯和极低密度脂蛋白水平下降，脂肪组织分解加速使血液中游离脂肪酸增加；另一方面由于载脂蛋白合成障碍，甘油三酯释放入血减缓，引起脂肪组织在肝内大量蓄积而导致脂肪肝。此外，摄入氨基酸不平衡的食物，如缺乏合成载脂蛋白所需的氨基酸如精氨酸、苏氨酸、亮氨酸、异亮氨酸等，载脂蛋白和极低密度脂蛋白合成减少，无法将肝细胞内的甘油三酯转运出肝脏而引起脂肪肝。
