肝穿刺主要适用于慢性肝炎的诊断，使医生能直接了解病人肝脏病变的程度，同时还可检测肝细胞中病毒分布及肝组织纤维化情况，进而指导病人用药，预测用药效果和判断病情发展趋势。此外，如长期出现不明原因的轻度黄疸，或转氨酶不正常，都必须经过肝穿刺检查才能明确诊断。怀疑有脂肪肝的乙肝病毒携带者，可以通过肝活检直接了解肝组织是否存在脂肪变性，是否有慢性炎症，或两者兼而有之，以便进行针对治疗。有不少病人，转氨酶时高时低，从病史、肝功能、B超等资料来看，肝脏病情比较轻，但经肝穿刺后，却发现肝脏炎症程度和纤维化程度都比较严重。所以，病人不能光看常规的生化检查指标，还要及时做肝穿刺检查。
一些肝炎患者害怕肝穿刺会伤害身体。其实，这种担心是多余的。穿刺前需到医院检查的相关项目有血小板计数、凝血酶原时间、出凝血时间、胸片、心电图等。如果以上检查正常且无肝内胆管结石或肝血管瘤，做肝穿刺应该是很安全的。
