表面抗原可反映肝内病毒水平 众所周知，当人体感染乙肝病毒（HBV）后，若在急性期内不能将之彻底清除，则变为慢性HBV感染，病毒会一直留在体内，随时可能“作怪”（病毒复制、升高，破坏肝细胞）。
其中，位于肝细胞核内一个叫cccDNA的基因，正是乙肝病毒复制的“原始模板”，所有HBV均靠它复制出来。
“我们平时所作的病毒量检测，其实是反映血液中乙肝病毒的水平，而表面抗原的水平，可以反映肝内的病毒水平。”陈力元（香港肝病学会主席、香港中文大学肝脏护理中心教授）解释，表面抗原滴度越低，肝内病毒量越少。尽可能地把肝内病毒持久抑制甚至清除，正是抗病毒治疗的最佳疗效。
治疗停药后，疗效仍在提高 正因表面抗原水平能反映肝内病毒的情况，且属于无创检查，故在治疗过程对其进行定量监测，可了解肝内病毒的情况，以及预测停药后的持续疗效（e抗原及表面抗原的变化趋向），对指导治疗意义重大。
例如，通过定期（如治疗24周、48周时）对表面抗原进行定量检测，除可了解e抗原变化外，还可及早获悉表面抗原能否消失，以及未来消失的可能性。
曾有针对e抗原阳性（大三阳）病人的研究显示，在使用聚乙二醇化干扰素α-2a治疗期间，表面抗原滴度下降到一定数值时，e抗原血清转换（大三阳转小三阳）率更高。且在这些病人中，部分还有望获得表面抗原清除。
“若表面抗原水平无多大变化，意味其消失的机会较低。”陈力元说，此时医生可尝试调整治疗方案，如延长治疗等，这样，有部分人仍可能出现表面抗原的滴度下降。
另外，陈力元表示，在干扰素治疗结束时，表面抗原的清除率并不高；但在停药后，疗效会随时间延长而逐渐提高。
一项对e抗原阴性（小三阳）病人的研究数据显示：在使用聚乙二醇化干扰素α-2a治疗48周结束后，表面抗原水平仍会继续下降，若降至一定水平，就可能出现表面抗原的清除（停药时的表面抗原清除率为3%，到第5年时，则达12.2%）。
国内医院也开始作定量检测 在过去的慢性乙肝治疗中，表面抗原自然转阴的概率非常低，曾一度被认为是“遥不可及”的目标。也正因此，乙肝病毒受抑制（检测不到）及e抗原血清转换（大三阳转小三阳），成为目前的现实治疗终点。
但是，在盖中涛（山东省传染病学会副主任委员、济南市传染病医院主任医师）看来，即便抗病毒治疗后，获得e抗原的血清转换，也只是达到较“理想”的目标，并非最终目标。表面抗原清除甚至转换（即表面抗原消失，表面抗体产生），才是最接近“临床治愈”的状态。
现在，随着药物研究的发展，表面抗原转阴并非“遥不可及”。所以，若有一定条件（包括身体条件及经济条件），也是可以有所追求的。
当然，就目前而言，国内能进行表面抗原定量监测的医院，仍屈指可数；且不少医生（尤其是基层医生）还不了解该方面的知识，故仍需进一步普及教育。
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