肝活检时，医师取出非常小的一块肝组织，在显微镜下检查，通过组织的异常表现确定肝损伤的程度。活组织检查可提供与CHB患者肝内纤维化和可能的肝硬化整体程度相关的全部信息。
目前常用的肝纤维化和炎症坏死评分系统有：
Knodell组织学活动指数（HAI）是最早发展的评分系统。该系统采用了4个与坏死（细胞/组织死亡）和炎症坏死的部位及程度相关的独立标准进行评分。四个指标各自的得分之和为总得分，范围从0-22。
HAI评分系统目前虽仍在使用，但在大部分情况下已被后来出现的Ishak和Metavir系统取代，这两个系统对分级和分期进行了区别。分级评价的是炎症坏死活动的程度——衡量进展性疾病，根据疾病的严重程度和治疗而变化。分期则是指纤维化程度和肝脏细胞结构、血管结构的改变程度。分期也可说明疾病的进展，且与分级相比，更加稳定。
Ishak系统是HAI的改良版本。该系统炎症坏死的分级评分范围为0-18，另外还对纤维化程度进行了7个分期。因而和HAI相比，Ishak系统能对纤维化改变做出更为细致和准确的评估（见表1）。Metavir系统是由一个法国的研究小组为研究慢性丙型肝炎的组织学分级而开发的。该系统包括四级组织学活性评分（A0，无；A1，轻度；A2，中度；A3，重度）和五期纤维化评分（见表1和图1）。
表 1 改良HAI的Ishak评分系统和Metavir评分系统
改良HAI的Ishak系统
Metavir 系统
得分
说明
得分
说明
F0
无纤维化
F0
无纤维化
F1
纤维化扩展到部分门管区，有或没有短的纤维间隔(dividing walls)
F1
肝门束扩大，但未形成间隔
F2
纤维化扩展到绝大部分门管区（围绕肝小叶中门静脉分支开口的区域），有或没有短的纤维间隔
F2
肝门束扩大，有小的间隔形成
F3
纤维化扩展到一些门管区，偶见门-门（P-P）桥接*
F3
间隔很多，无肝硬化
F4
纤维化扩展到一些门管区，有明显的P-P桥接和门静脉-中心静脉（P-C）桥接
F4
肝硬化
F5
显著的桥接（P-P和/或P-C），偶见结节形成（不完全肝硬化）
–
F6
肝硬化，可能的或确诊的
–
* 桥接是指一个区域（例如门管区）的纤维化范围延伸，和另一个区域（如另一个门管区或中心静脉）的纤维化相连
表2对 HAI、Ishak和 Metavir评分系统进行了比较。
表2 肝活检评分系统
评分系统
炎症坏死
纤维化
总分
HAI
0~18
0~4
0~22
Ishak 改良的 HAI
0~18
0~6
0~24
Metavir
0~3
0~4
0~7
肝活检在诊断和监测治疗应答中的作用
肝活检被认为是确定纤维化程度的金标准，而且对肝损伤的预测作用比ALT水平更为灵敏和准确，因而肝活检可用于CHB 的确诊。在开始CHB治疗前行肝活检不仅有助于确定肝损伤的程度，而且有助于排除引起肝脏疾病的其他可能原因。
由于肝活检提供了有关肝脏病变的活动程度和纤维化的准确评估，因而在评价CHB患者对抗病毒治疗的应答时，它也被作为一种理想的方法加以应用。肝活检已经在治疗乙型肝炎的临床试验中广泛用于评价治疗结果。然而，肝活检是侵入性的，有产生并发症的风险，还可伴随显著的疼痛和不适感。更严重的并发症包括出血、胆漏和败血症休克——一种可能致命的血液并发症。肝活检禁用于失代偿性肝硬化，在代偿性肝硬化中通常也尽量避免。因而临床中肝活检不作为一个常规的检查手段。
近年来也开发了非侵入性的用于评估肝纤维化的替代检测方法。Fibro检测即是其中一种，已得到了深入的研究，并在慢性丙型肝炎中得到了验证。在不久的将来，它的应用将很有可能扩展到慢性乙型肝炎领域。
