乙肝小三阳意味着体内有病毒的存在，但自身的免疫功能具有控制病毒不在体内大量复制的能力，因此小三阳会传染，只是传染性相对比较的弱。但是人体免疫力长期处于战斗状态又没有足够消灭病毒的免疫力会导致免疫功能紊乱易形成细胞突变（肝癌）。在自身免疫力低下时，病毒也会大量复制（向大三阳转换使病情加重），当自身免疫功能获得提高时也可能会自然转阴。
一直以来，医学界都以为“小三阳”患者只是体内带有病毒，但不会传染他人，不会伤害肝脏，也不会影响正常生活,可以不用治疗；一般群众也多不把“小三阳”当回事。但据最新医学资料显示，如果属于转氨酶高，病毒活跃的“活动性小三阳”就得治疗。否则，肝脏会朝纤维化——肝硬化——肝癌的方向发展。包括医生和一般病人以往都认为，“乙肝小三阳”病情比“乙肝大三阳”轻，小三阳病情稳定，
传染性小，基本无需治疗。
但事实上，与“与国内大三阳”患者相比，小三阳患者群体年龄偏大（平均大10岁）；肝脏炎症及纤维化、肝硬化程度更重，这是多次肝损害累积的结果。
“小三阳”只是表明病毒复制水平较低，病毒模板仍顽固地贮存在细胞核内，一旦条件适合就可以重新进入复制状态变为“大三阳”。 因此，凡转氨酶高，病毒活跃的此类“活动性小三阳”就得治疗（病毒仅复制但没活动的不用治疗）。否则，肝脏会朝纤维化——肝硬化——肝癌的方向发展。
