1 选用药物不当
为乙肝病人选用的药物不对症，没有考虑特殊病人的用药禁忌，合并用药配伍失当等。如慢性活动性乙肝患者肝功反复波动，血清胆红素显著升高，此时如果选用干扰素、拉米呋啶等抗病毒药物，就属于用药不当。又如一些特殊病人，如失代偿肝硬化已出现腹水，合并有自身免疫损害，这些患者对干扰素等抗病毒药物属于禁忌症。乙肝患者配伍使用免疫增强剂，一般需对患者的细胞免疫和体液免疫情况进行检测，如果患者细胞免疫功能低下，配伍使用免疫增强剂可有正面效果;如果患者免疫功能正常，使用免疫增强剂则没有任何积极意义。
2 用药不足
包括剂量太小和疗程不足。如经临床研究证实，使用。类干扰素治疗乙肝的合适剂量为500～600万单位，隔日一次肌肉注射;而以往大多使用300万单位，难以保证疗效。又如拉米呋啶治疗乙肝，曾经建议疗程为1年，但是大量临床研究表明，使用一年虽然可以获得较为理想的疗效(肝功正常、乙肝病毒脱氧核糖核酸和乙肝病毒。抗原阴转)，但是一旦停药，转氨酶马上升高，乙肝病毒复制指标再次转阳。目前认为拉米呋啶不能过早停药，应坚持使用2～3年以上时间。
3 用药过量或过分
虽然给病人使用了对症的药物，但剂量过大或疗程过长，给轻症病人用重药，联合用药过多等。如单磷酸阿糖腺苷治疗慢性乙肝的合适剂量和疗程是：成人每天0.4克，30天为一疗程。有些患者用量达到每天6.8克，疗程超过3个月，结果出现神经肌肉疼痛及关节疼痛综合征。
4 不适当地合并用药
未根据治疗需要和药物特性设计合理的给药方案，无必要或不适当合并使用多种药物。治疗乙肝主张联合用药，主要考虑从抗病毒、免疫调整、恢复肝功、抗肝纤维化四方面联合用药，但是需根据每个病人的具体情况，掌握主次。联合用药不主张累积、重叠使用相同药物，如同时使用多种清热解毒类中成药;不主张多种免疫调节剂同时使用，如同时使用转移因子、免疫核糖核酸、左旋咪唑等。
5 无适应症用药
目前认为乙肝病毒携带者处于免疫麻痹阶段，此时不主张使用特殊药物治疗。但是现今临床普遍存在对乙肝病毒携带者的安慰性治疗，如各种中药制剂、保肝药物、免疫调节剂等。
6 无必要地使用昂贵药品
乙肝药物普遍价格昂贵，尤其是各种“新特”药物，有的一疗程下来要花数万元，普通老百姓难以承受。但是，许多人仍然错误地认为药物价钱和疗效呈正比，盲目追求昂贵新药。对轻度慢性乙肝患者主张给予适度的治疗，切忌大量使用昂贵的新特药物。
7 给药时机和途径不适当
目前乙肝抗病毒治疗多主张病变处于炎症活动期，转氨酶升高2～10倍，没有出现黄疸，乙肝病毒复制指标阳性。但有不少的病例不符合抗病毒时机，却硬性使用干扰素、拉米呋啶等抗病毒药物，往往收效不佳。
8 重复给药
有的患者辗转各地，四处求医，但是所得处方用药，虽然药名不同，实际药物成分相似。如主要成分为中药五味子的各种保肝降酶中成药多达数十种，患者不知其中详情，有时同时并用3种以上同类保肝降酶药物。
