吸毒也会把人推向感染丙型肝炎和艾滋病的边缘。吸毒者有30%会染上丙型肝炎。吸毒者通过静脉注射以求更快速满足毒瘾时，使用不洁注射器或共用注射器，都会直接造成病毒传播。患者可有黄疸、尿黄如茶等症状。不到1%的病人会在急性肝炎出现时不治身亡，那些逃过死亡劫数的将演变为慢性肝炎患者，成了带菌人，他们患肝癌的概率也比一般人高出99倍。
经皮暴露感染这是目前最主要的丙肝传播途径，静脉吸毒又是经皮暴露感染的最主要方式；此外，有些地区仍在使用非一次性的玻璃注射器和针头，构成了HCV传播的危险；针刺等职业性暴露也是经皮暴露的一个重要因素，针刺传播HBV、HCV和HIV的机会分别为30%、3%和0.3%；共用剃须刀、牙刷等可能接触血液的卫生用品也可能是HCV传播的方式之一；一些可能导致皮肤破损和血液暴露的传统医疗方法也与丙肝传播途径有关。
吸毒者采取静脉注射吸毒时，也有可能感染艾滋病，其发生概率不算高，只有0.3%。问题是艾滋病是一种危害性极大的传染病，到目前为止仍无法根治。
吸毒者还可能感染心内膜炎（endocarditis）。使用不洁注射器，采用掺杂了感染原的毒品的吸毒者都面对这一风险。
