复旦大学上海医学院医学分子病毒学重点实验室袁正宏课题组、市公共卫生临床中心科研人员等合力攻关，通过长期研究，揭示了乙肝长期迁延不愈的根本原因，同时监测到慢性乙肝抗病毒治疗后cccDNA清除情况。相关研究在线发表在国际期刊上。
乙肝病毒是严重影响人类健康的病原体，它是造成慢性乙肝的元凶。世界卫生组织2015年的研究估计，全球约有2.4亿慢性乙肝患者，大多分布在低收入、中等收入国家。每年约有65万人死于慢性乙肝感染所致的肝衰竭、肝硬化、肝细胞癌。我国现有慢性乙肝感染者9300万人，在肝硬化、肝细胞癌患者中，由乙肝病毒引起的比例分别高达60%、80%。随着我国乙肝疫苗接种的推行，婴幼儿乙肝阳性率大幅降低。但对其他感染病毒者，仍缺乏彻底治愈方法，为家庭造成沉重的经济和健康负担。
论文第一作者、市公卫中心科学研究部博士张小楠介绍，大量临床与基础研究表明，慢性乙肝长期迁延不愈，根本原因在于乙肝病毒共价闭合环状DNA（简称cccDNA）在肝内长期存在，继而导致病毒表面抗原血症。由于cccDNA在患者体内水平极低，传统的分子生物学方法不仅检测困难，而且无法显示其组织内的分布特点。
在袁正宏指导下，张小楠在bDNA信号扩增技术基础上二次开发，成功建立了一种能在组织水平显示cccDNA分布的原位杂交技术。该技术同时可显示乙肝病毒的其他复制中间体。研究组将原位杂交、乙肝病毒主要抗原的免疫组织化学染色结合，获得了病毒核酸与蛋白质的综合图像。令人意外的是，乙肝病毒抗原与核酸在单细胞水平均呈现惊人的“马赛克状”分布，即病毒的cccDNA。研究进一步证实，经过1年以上抗病毒治疗的患者，肝细胞内仍存在乙肝病毒cccDNA。
研究组于是提出：在单细胞水平乙肝病毒存在“抗原富集期”“DNA富集期”和“潜伏期”的三阶段假说，推测患者体内肝细胞生理水平、病毒复制活跃度的变化可以导致三个阶段的相互转换。这一假说在单细胞水平描述了病毒生活周期的复杂变化模式，为进一步针对患者不同病情设计清除乙肝病毒cccDNA提供理论基础。
