目前对庚型肝炎的治疗尚无特效方法，以强调休息、护肝和抗病毒治疗为主。应用干扰素可以降低血清庚型肝炎病毒滴度。用法：干扰素3百万单位／次，3次／周，疗程3-6个月。庚型肝炎病毒对干扰素较敏感，但终止用药后其滴度又会恢复至治疗前水平。仅不足三成病例HGV-RNA持续转阴。有报道证实，从曾经接受干扰素治疗的慢性丙型肝炎和乙型肝炎病例中，发现有与HGV同时感染的病例，在接受干扰素治疗后，此类同时感染的病人均有复发。
有人采用病毒唑治疗，大约35％的病人ALT水平下降，但对血请中HGV-RNA变化没有影响。一般认为，病毒唑无抗庚型肝炎病毒效应。鉴于目前的治疗状况，预防庚型肝炎是重点。由于现在尚未研制出庚型肝炎病毒的保护性抗体，易感人群不易保护，所以主要应切断感染途径。
