1、专家们一致认为，α干扰素是目前治疗丙肝惟一有效的药物，故希望丙肝患者不要轻易放弃干扰素治疗。我们曾遇到数位丙肝患者应用α干扰素3～6个月没有反应，而应用到9个月时疗效明显，一直应用到12个月甚至更久，取得理想疗效。有人曾提出，应用干扰素6个月无效就要停用，这不一定准确，停用干扰素还能用什么?丙肝进展缓慢，与乙肝不同，干扰素治疗的疗程一定要充足。当然也可增加剂量，由300万单位/次增加到500万～600万单位/次。
2、可改用复合干扰素。复合干扰素是应用基因重组技术，对干扰素各种亚型进行重组而得到的非天然干扰素，它比原来的α干扰素的抗丙肝病毒作用至少大5倍，不良反应为轻到中度，与其他类型干扰素相似。丙肝病人使用其他类型干扰素无效时，可改用复合干扰素，每次皮下注射9微克，每周3次，6～12个月为一疗程。此药国内市场上有售，上海等地已应用于临床，效果较好。
3、联合用药。目前推荐的方案是干扰素联合病毒唑(利巴韦林)，还可应用干扰素联合胸腺肽(Tα1)，后者每次1.6毫克皮下注射，每周应用2～3次。新近研究，国产中药氧化苦参碱注射剂除有抗乙肝病毒作用外，还有抗丙肝病毒作用，有人应用于临床，每次200毫克肌注，每日2次，疗效很好，不逊于干扰素。可和干扰素联合应用治疗丙肝。
4、丙肝治不好还要分析原因。一般如果丙肝合并肝硬化、脂肪肝、糖尿病、心脏病、胆道感染、HIV感染等，都难以治疗。此时对于合并症也应适当治疗，否则不会收到满意效果。还有研究发现，许多难治性丙肝病人血清铁较高，肝细胞内含铁也多，影响疗效。有人给丙肝患者应用乳铁蛋白，使其结合过多的铁，排出体外。乳铁蛋白是一种转铁蛋白，同时有免疫调节作用。
5、治疗适应症问题也很重要。有的丙肝病毒感染者不是治疗适应症患者，或者不是应用干扰素治疗的适应症患者。病人血清ALT(丙氨酸氨基转移酶，即原GPT)水平正常者不是抗病毒治疗的适应症患者;无纤维化(FO期)或轻微肝纤维化(F1期)也不一定需要抗病毒治疗。肝硬化及肝功能失代偿患者通常不给予目前的抗病毒治疗，因为治疗无效。专家们建议，丙肝的肝纤维化F2期和F3期是抗病毒(干扰素)治疗的最佳适应症，肝硬化早期可考虑抗病毒治疗。丙肝病毒基因型与抗病毒治疗也有关系。所以，慢性丙肝病人应争取进行肝活检和丙肝病毒基因型及病毒载量的测定，为治疗提供可靠的依据。
6、疗效判定不能完全以ALT为标准，主要应以丙肝病毒核糖核酸(HCVRNA)来验证。如果HCVRNA转阴，说明治疗的效果好;如治疗结束，HCVRNA仍为阴性，这叫“持续应答”，最理想。有的患者以抗—HCV的阳性或阴性来判断干扰素疗效，这是不对的，抗—HCV是抗体，当HCVRNA转阴后，抗—HCV仍然可以阳性，可持续数年不消失。所以丙肝病人在治疗前后一定要检测HCVRNA，以准确判定干扰素的疗效，莫将有效当无效。
