感染丙型肝炎病毒的初期，患者没有任何不舒服的感觉。在2个月左右的潜伏期后，只有大约四分之一的病人会出现食欲差、疲倦、黄疸等症状；而大部分的患者却没有任何感觉。而且，感染后大约要经过二十年左右才会出现肝硬化。因此，有很多人根本不知道自己已经被感染。
因此，要想知道自己有没有感染上，最重要的办法是查看血液中是否有病毒。病人在急性感染后的数天内，血清中会出现病毒RNA，并且在产生抗体前一直会存在几个月，所以通过检查病毒抗原或病毒RNA可以帮助早期诊断。
但是，目前用的试剂是利用丙型肝炎病毒基因所产生的病毒蛋白做成的，所以，并不能直接检查。而且，由于血液中的丙型肝炎数量相当少，有时甚至测不出。这并不表示没有丙型肝炎了，只是代表病毒当时的活性很低。
病毒在体内悄悄地“躲藏”7-8个星期之后，这时，在患者的血液中可查出丙型肝炎病毒的相关抗体。但是，这种抗体并不具有中和或者消除入侵病毒的作用，也就是说，这种抗体是没有保护作用的，这是和乙型肝炎不同的地方。因此，丙型肝炎病毒抗体阳性，并不表示不会再得丙型肝炎，只是代表病人曾经感染过或正在感染丙型而已。
