并发症可由肝癌本身或并存的肝硬化引起，常见于病程晚期，故常是致死的原因。
(一)肝性脑病 常为终末期的并发症，占死亡原因的34.9%。
(二)消化道出血 占死亡原因的15.1%，合并肝硬化或门静脉，肝静脉癌栓者可因门静脉高压而引起食管或胃底静脉曲张破裂出血，也可因胃肠粘膜糜烂，凝血机制障碍等而出血。
(三)肝癌结节破裂出血 发生率约9～14%，肝癌组织坏死，液化可致自发破裂或因外力而破裂，如限于包膜下可有争骤疼痛，肝迅速增大;若破入腹腔引起急腹痛，腹膜刺激征，严重者可致血性休克或死亡，轻者经数天出血停止，疼痛渐减轻。
(四)血性胸腹水 膈面肝癌可直接浸润或经血流或淋巴转移引起血性胸水，常见于右侧。
(五)继发感染 因癌肿长期的消耗，抵抗力减弱，尤其在放射和化学治疗后血白细胞下降者，易并发各种感染：如肺炎、肠道感染、真菌感染等。
