脂肪肝主要是不良生活方式引起的疾病，因此，在治疗原则上一般以纠正不良生活方式为主，使脂肪肝逐步逆转。对于症状较重者，必要时辅以保肝、去脂及抗纤维化药物进行治疗。
饮食疗法：
对酒精性脂肪肝，戒酒及改善营养状况是基本治疗方法。禁酒和纠正营养不良可使大部分脂肪肝在1～6周内消退，也有需4个月或更长者。饮食主要为高热量、高蛋白（每日高于正常60g），适量补充维生素。蛋白质摄入不足，可促使继续形成脂肪肝。
对肥胖相关性脂肪肝，重点是减重。减轻体重可改善肥胖伴同的糖尿病、高脂血症，并使脂肪肝消退，饮食疗法和锻炼是减重的基础，减重10％可使脂肪肝引起的转氨酶增高恢复正常。但减重方法需在医生的指导下进行，特别是伴有糖尿病、心肾疾病及肝损害明显的病人更要注意。
通过进食低热量饮食或饥饿疗法使肥胖者体重减轻后，脂肪肝的程度可改善并使肝功能恢复正常。但如体重骤减（一个月减下5公斤），则会导致动员脂肪组织入肝增多，并刺激胰岛素分泌增多，也易发生脂肪肝并使原有脂肪肝的患者病情进一步加重。
药物辅助治疗：
目前临床上尚无满意的干预脂蛋白代谢的药物。非酒精性脂肪肝去除病因为主，减重、饮食治疗并辅以药物可有效地控制病变的进一步发展，并促使病情逆转。
1.胆碱：仅适用于营养不良性脂肪肝。
2.生物膜保护剂：必需磷脂（易善力）和多不饱和卵磷脂，可减少肝细胞的脂变，保护和修复受损的肝细胞膜及其伴同的炎症和纤维化，但对不能戒酒者慎用。
3.抗氧化剂：还原型谷光肝泰、水飞蓟素（益肝灵）、VE、牛磺酸等具有一定的降酶保肝作用，并可减少诱发的肝纤维化，其确切疗效有待证实。S－腺苷甲硫氨酸（蛋氨酸）对酒精性脂肪肝有效。
4.熊去氧胆酸：对脂肪肝、酒精性肝病等有明显的治疗作用，是一种有良好前景的去脂药物。
5.中药：大、小柴胡汤对脂肪肝有治疗效果。比较有效的药物有胆宁片、血脂康、绞股蓝总甙等，中成药由于毒副作用小，因此应用前景广阔。
