乙肝的HBeAg(e抗原)分阳性或阴性，阳性者一向作为乙肝复制，传染性和治疗中的客观指标；药物治疗中由大三阳转小三阳，即(抗HBe)的出现，常提示临床抗病毒获得阶段性成功。但近年发现：EaG阴性(前C区/或C区变异，使HBEAG无法或仅极低水平表达)的慢性乙肝患者发展为肝硬化和肝癌的几率也很高。
20世纪90年代以来除没用HBEAG转阴/抗HBE转阳外，更重视查HBV DNA定量。因为：
HBV DNA是乙肝病毒复制活动最直接，最可靠的指标；
HBV DNA阳性亦是判别乙肝患者或携带者传染性的指标；
HBV DNA定量的定期检测 ，可判定乙肝感染量的消长，临床病情的是否稳定和好坏，还可直接评价监测抗病毒药的疗效。
(HBV DNA的检测方法不一样，其正常值亦不同，解放军302医院检测HBV DNA用PCR法，其HBV DNA定量的正常值范围小于500/拷贝/毫升)
有经验的临床医生：既重视慢性乙肝HBEAG指标的阴阳性，又重视HBV DNA复制量的消长，必要时应检测基因变异的位点。
