治疗乙肝病毒的根本目的和终极指标是清除cccDNA，cccDNA名字为共价闭环DNA，乙肝病毒的基因（DNA）是有两条螺旋状DNA链（一条正链，一条负链）围成的环形结构，较长的负链形成了完整的环状，较短的正链没有闭合，呈半环状。感染肝细胞后，正链以负链为“模板”复制延长，形成完整的环状的双股DNA即cccDNA。可以把cccDNA看作是病毒复制的“原始模板”和核心。共价闭环DNA(cccDNA)在慢性乙肝复发过程中发挥重要作用，可惜的是目前各种抗病毒药物，尚难以撼动cccDNA，现在临床上常用的抗病毒药物,核苷(酸)类似物和干扰素均不能直接清除cccDNA,而须依赖机体的免疫系统。研究表明,在持续
应用抗病毒药物的情况下,机体清除感染cccDNA的肝脏细胞需14.5年。在这个过程中,抗病毒治疗可阻断cccDNA的再循环,降低cccDNA再产生。依照目前治疗乙肝的水平，最易达到的目标是获得“铜牌”，即乙肝病毒DNA转阴，较难达到的目标是乙肝病毒e抗原消失、e抗体形成（获得银牌），极难达到的目标是乙肝病毒表面抗原转阴（获得金牌）。HBsAg即乙肝病毒表面抗原，其最早在澳大利亚被发现，曾被称为“澳大利亚抗原”即“澳抗”。 HBsAg 是病毒的包模。血液中化验出HBsAg，说明机体感染过乙肝病毒。乙肝病毒表面抗原(HBsAg)的清除与cccDNA存在一定相关性,清除HBsAg是cccDNA水平显著降低的标志,而HBsAg清除一直以来都被作为乙肝抗病毒治疗的最终目标及“治愈”标志，其实乙肝治疗的终极目标应该是彻底清除cccDNA，目前国内一些权威医院正在将肝组织学中cccDNA的检测
推广至临床，在这努力尚未
推广至临床之前，清除乙肝病毒表面抗原依然是治疗的最终目标，研究显示,HBsAg(-)患者14年死亡率显著低于HBsAg(+)患者。HBsAg(+)患者肝硬化或肝癌死亡风险远远大于HBsAg(-)患者。HBsAg清除率会随年龄增长而增加,但50岁后获得HBsAg血清转换的患者预后不及50岁前获得HBsAg血清转换者。显而易见，HBsAg清除越早,患者预后越好。但目前乙肝抗病毒治疗药物的HBsAg清除率均不理想。
