在乙肝的治疗中，一方面要纠正几种错误认识，积极采取正规的抗病毒治疗，另一方面也要选择合理的治疗方案。在观念上不要“过虑”，为避免治疗中出现的副作用，而采取不治疗或延后治疗的举动是要不得的，会因此错失治疗时机。还要要避免几种误区：
一、盲目追求降酶保肝
中国是一个乙肝人群中多的国家，约有1亿左右乙肝携带者，3000多万的乙肝患者。然而国内在乙肝的治疗上一直存在不规范的问题，存在严重认知误区。中国肝炎防治基金会于05年公布的《中国肝炎的流行现状及其相关问题分析报告》显示，仅有19％的人在接受抗病毒治疗。相当部分的患者单纯追求护肝降酶。这样往往导致表象上乙肝被“控制”，实质上，因为单纯护肝降酶不作用于病毒，病毒导致的肝脏病理变化仍在持续，炎症持续进展，很有可能发展为肝硬化、失代偿。
二、乙肝目前对身体没什么影响，而治疗又有副作用，晚些再治疗吧
专家明确指出对于治疗中的副作用，过分的担忧是没有必要的，一方面，乙肝治疗的副作用大多都能控制，而且一旦停药后这些副作用均为可逆性的。害怕副作用影响学习、生活，在不了解疾病进程的情况下，自行决定治疗时间，很可能会导致患者错过治疗的最佳时机。专家建议，一旦确诊慢性乙肝，应及时就诊，采取正确的抗病毒治疗，这样才可以获得最佳的疗效，为自己争取到健康生活的机会。
三、病毒载量下降（HBV DNA）下降慢就是治疗没有效果
专家也指出，若是仅仅通过外来药物抑制病毒复制，在治疗期间乙肝病毒载量可以降低，但是长期使用外源药物打击病毒，病毒很有可能产生耐药性，疗效因此减退。更须注意的是，由于合成病毒的基因依然存在于人体中，一旦停药，离开了外来的作用力，体内病毒又会卷土重来，病情可能恶化。
在治疗上，不可“冒进”，一味贪求短时间内打败病毒、肝功能复常，可能会由于治标不治本，而导致疾病持续进展。专家指出，免疫调控是慢性乙肝治疗成功的关键因素之一。
什么是免疫治疗？
乙肝病毒感染肝脏细胞后，人体自身免疫系统会识别病毒身上具有标志性的部分，即抗原（如e抗原），生成针对抗原的抗体，或免疫清除细胞。这些抗体或免疫清除细胞破坏并清除病毒和被病毒感染的肝细胞。 一旦免疫系统开始识别病毒，人体会产生干扰素。干扰素的作用是调动自身免疫，加强“识别——破坏——清除”反应；同时直接抗病毒。
但自然状况下，机体生成的干扰素非常少，不足以把“识别——破坏——清除”的反应进行到底。外源性的干扰素尤其是聚乙二醇化干扰素（PEG干扰素），因而成了治疗慢性乙肝的生力军。它充分调动机体免疫识别e抗原，促进e抗体生成，更好得清除乙肝病毒及其抗原。当e抗原的消失，e抗体出现（即通常说的e抗原血清学转换）时，标志着一支和乙肝病毒长期斗争的有生力量已在机体内形成，病毒复制得到持续抑制、甚至清除，肝功能恢复正常。通俗的讲就是，e抗原阳性，说明在乙肝病毒和机体免疫力的对抗中，乙肝病毒占上风，如果e抗原阴性，出现e抗体，说明机体免疫力占上风。因此，一旦出现e抗原血清学转换，在停止免疫治疗后，病情仍可持续缓解，肝脏病理变化也可以得到阻断，炎症减轻；发生肝硬化、甚至肝癌的几率大大减少。因此在最新制定的《中国慢性乙肝防治指南》中，干扰素，尤其是聚乙二醇干扰素(PEG干扰素）被推荐为慢性乙肝治疗的一线用药。
正确地评估治疗的疗效
在慢性乙肝的治疗中，不能说HBV DNA下降越多疗效越好，HBV DNA下降慢就是无效，比较好的评估方法是e抗原血清学转换（e抗原消失，e抗体出现），e抗原血清学转换，患者发生肝硬化、肝癌的风险将明显降低。如果仅仅是HBV DNA下降，而未发生e抗原血清学转换将不可避免的出现HBV DNA波动，病情复发；但如果发生了e抗原血清学转换，HBV DNA则比较稳定。另外，在乙肝的治疗过程中，HBV DNA的下降与e抗原血清学转换并不成正比，因此，在乙肝的治疗中，尤其是在干扰素的治疗中，观察e抗原血清学转换的发生情况更重要。
