抗病毒治疗是治疗乙肝的最重要环节，通常抗病毒取得良好效果后，乙肝治疗也就成功了一半。但不是每个乙肝病人都需要抗病毒。长沙方泰医院中西结合肝病诊疗中心的许爱良医师说：“乙肝抗病毒治疗要仔细，在进行抗病毒治疗之前，必须得综合考虑HBV-DNA、肝功能、肝组织学检查(即肝脏穿刺检查)这三项检查结果，这样才能确定治疗方案”。
HBV-DNA：“大三阳”病人的病毒DNA数量达到105拷贝/毫升，“小三阳”病人的病毒DNA数量达到104/毫升，这个数值便是乙肝病毒复制活跃的依据。
肝功能：转氨酶高于正常值上限的2倍，这个时候是进行抗病毒治疗的最好时机，否则不仅疗效不佳，搞不好会产生耐药、病情反跳，导致重症肝炎。
肝组织学检查：转氨酶虽小于2倍正常值上限，但肝组织学结果发现，肝纤维化指标已超标到一定级别，或炎症坏死较重。三条之中，第1条是必需条件。在符合第1条的前提下，再具备第2条或第3条，便符合抗病毒的指征了。
因此，是否需要抗病毒治疗的标准并不是“大三阳”就要抗病毒，“小三阳”可以不抗病毒。对乙肝病毒携带者中的慢性乙肝病毒携带者(HBV-DNA阳性，肝功正常)，最好做肝穿刺检查，然后决定是否抗病毒治疗。而非活动性乙肝病毒表面抗原携带者(乙肝表面抗原阳性、e抗原阳性、HBV-DNA阴性、肝功能正常)，可不必抗病毒治疗，但要定期随访复查。
所以，抗病毒需综合各方面的因素，对症下药。
