许多乙肝病人经过正规治疗后，可见病毒复制指标阴转。此时应科学、慎重地判定阴转实质，以便有针对性地拟订此后一段时间的治疗方法和用药。
谨慎选药，剂量个体化有的患者通过用药或其他治疗方法，出现乙肝病毒指标阴转，有时甚至e抗体和核心抗体也呈阴性。这种情况多见于急性乙肝恢复后或慢性乙肝病毒携带者自愈。此时患者症状和体征明显好转，肝功能恢复正常并保持稳定。若原是急性乙肝，因机体免疫功能大都正常，可选1～2种药物维持治疗，如肝泰乐、齐墩果酸等，用药时间1～2个月。若原是慢性乙肝，因免疫调节功能紊乱，难以从根本上调节机体对HBV的免疫反应，致使HBV得不到清除，则治疗的关键是联合应用抗病毒与免疫调控药物，使免疫功能正常化，提高抗病毒疗效。病毒复制指标阴转后最好继续用药，同时再加些护肝药。若此时停药可能会前功尽弃。患者应该根据自身病情、病程以及各项检查结果，请医生帮助调整用药种类和剂量，即应注重个体化治疗。
病毒变异，防肝纤维化有些患者虽然病毒指标阴转，病情却越来越重，疲乏无力，腹胀纳差，面色萎黄或晦暗，出现肝掌、蜘蛛痣等。这些表现说明病毒指标阴转的实质是病毒变异造成的，这既能导致医生误诊，也是乙肝疫苗接种失败的原因。因此，乙肝患者不可单纯追求阴转。发生病毒变异的乙肝患者如不加治疗，肝细胞将无休止地被病毒破坏，最终可发展为肝硬化。最新研究表明，早期肝硬化是可逆的，如果能及早进行抗纤维化治疗，则有利于阻止、延缓、逆转病情发展。因此，对乙肝患者来说，抗病毒和抗纤维化治疗同等重要。在此阶段，不宜骤然停药，同时也不能无限制地使用多种药物。因为任何药物都必须通过肝脏降解，用药较多必然会增加肝脏负担，对治疗和预后皆不利，故用药要有计划，治疗要有序。
