新版《慢性乙型肝炎管理指南》指出慢性乙肝治疗的最终目的是:最大限度地长期抑制或消除乙肝病毒，减轻肝细胞坏死以及肝纤维化，延缓和阻止疾病进展，减少和防止肝脏失代偿、肝硬化及其并发症的发生，从而改善生活质量和延长存活时间。只有规范治疗，才能获得上述理想效果。
围绕着这个总体目标，国内外公认有效的治疗就是抗病毒治疗。抗乙肝病毒的药物主要包括干扰素类(普通干扰素、聚乙二醇干扰素)和核苷类似物(包括阿德福韦酯、拉米夫定等)，并各有其优缺点。只是苷类似物的优点是口服给药，缺点是长期服用可产生耐药变异，停药后可出现病情恶化等。据统计，拉米夫定使用五年左右的时间，有将近一半的患者会产生耐药性。
从临床情况来看，不规范治疗包括两个方面，第一是由病人依从性差造成的。如自己没有时间坚持治疗，或者不听从医生的嘱咐吃吃停停，等等。第二是不正规的医治导致的。抗病毒治疗涉及到很多技术性的问题，包括用什么方案最合适，疗程到底要多长，如何联合用药，何时停药最好，如何进行监控等。如果医务人员专业知识有限，或者责任心不够，就很可能会导致医治不规范。
乙肝治疗不规范将会引起一系列问题，如服用药物不规范，可能在治疗无效的同时还增加肝脏负担，还会导致病毒耐药。此外，治疗不对症还有可能导致患者免疫系统紊乱，增加后续的治疗难度，严重的还会导致肝硬化、肝癌。
需要说明的是，不规范停药也是不规范治疗的一种。因为口服抗病毒治疗，更多考虑的是治疗的终点，即安全停药的原则和标准，而无确切的疗程。其主要原因是现有核苷类似物的口服抗病毒药，都仅能通过抑制病毒复制而不能直接杀灭和清除病毒，因而只有长期治疗才能长期受益。尽管有20%的患者在大三阳转成小三阳后，在DNA阴性、肝功能正常的情况下，经巩固治疗一年，可以尝试停药。但在停药时也需1~3月内做相关复查，以便及时发现病情反弹的情况，必要时再用药。如果在不当的时机停药或停药后不复查，短期内都有可能出现重型肝炎或肝硬化，时间长了也可能转化为肝癌。
