从肝炎到肝硬化，每个阶段情况不同，治疗目标也不一样。贾继东教授强调“慢乙肝患者，我用药是希望他不得或者推迟肝硬化;有肝硬化的患者，我希望他维持在代偿期，不发生失代偿或肝癌;到了失代偿，治疗以后可以改善病情可以延长生命，这就是步步为营的策略。”
针对慢乙肝患者，2010年最新出版的《慢性乙型肝炎抗病毒治疗专家共识》指出，HBV DNA水平超过1×104拷贝/ml和(或)血清ALT水平超过正常值上限的乙肝患者都需要进行抗病毒治疗。此外，肝活检显示中度至重度活动性炎症、坏死和(或)肝纤维化的患者，也应该立即开始抗病毒治疗。坚持长期有效的抗病毒治疗，并定期监测能够有效控制住病情，减少发生肝硬化、肝癌等严重并发症的几率。
代偿期肝硬化患者，如果检测到乙肝病毒，即使肝功能正常，也需要积极进行抗病毒治疗。出于副作用的考虑，多数临床医生推荐此期的病人使用核苷类药物进行口服抗病毒治疗;如果非要用干扰素，必须谨慎小心。除此之外，代偿期肝硬化患者还要“未雨绸缪”，预防发生肝细胞癌、胃食管静脉曲张破裂出血等严重的并发症，造成 “病上加病”的恶果。
如果肝硬化到了失代偿期，就不得不运用核苷(酸)类药物进行终生治疗。只有通过抑制病毒复制、改善肝功能，才能延缓或减少肝移植的需求。由于干扰素有诱发肝衰竭的危险，在此期病人的治疗中不宜使用。
