很多患者都疑问一旦开始乙肝治疗需要多长时间，达到什么目标?
大部分的人要彻底治愈，表面抗原转阴很难达到，只有很少的一部分病人能够达到，对于大部分乙肝患者E抗原转阴，E抗体出现，乙肝大三阳变成乙肝小三阳，转氨酶也正常，这样愈后相对比较好，但是这个改善是相对于高病毒载量E抗原阳性的乙肝患者而言，与从未感染过乙肝的人相比是有区别的，。很多人要求彻底治愈，像广告宣传的大小三阳一律转阴，那只是广告，目前全世界都不能达到。
抑制乙肝病毒究竟要多长时间?
干扰素一般要打半年或者一年标准疗程，经过注射，E抗原阳性的可以转为E抗原阴性，病情得到稳定，这样就可以停药，疗程比较固定。
口服药物非常方便，一天吃一片，抗病毒也非常好，吃上以后病毒压下来，但是有一个问题——E抗原血清转换率相对比较低，只要E抗原不发生血清转换，停药以后就很容易复发，所以过去规定，如果乙肝治疗达到大三阳转成小三阳之后继续巩固治疗半年，但是现在我国规定巩固治疗一年，疗程延长了。
对于E抗原阴性，本来就是小三阳的病人，治疗后病毒转阴，因为患者本身没有E抗原，只能看DNA和转氨酶，这样的病人达到病毒转阴和转氨酶正常后，观察一年半以上可以停药，我国规定至少一年半，停药后相当多的人复发，特别是在亚洲中国这样的国家。
规定是最短的疗程并非最有效的疗程
形象来说，可以对干扰素治疗先治疗半年或者一年，有一部分病人达到目标可以停药，如果达不到目标可以再口服药物，那就需要长期治疗。乙肝现在还没提终生治疗，但是这个乙肝治疗是相当漫长的。
乙肝治疗的另外一个问题就是耐药性，口服药会发生耐药性，干扰素的优点是疗程相对固定，一旦停药后疗效比较持久，耐药变异小，但是需要注射给药，会出现发热、乏力、掉头发等等，有肝硬化腹水的病人不能用。口服核苷类药物，肝功能很差的人也可以应用，缺点是疗程不固定，停药之后容易复发，E抗原转换率比较低，还有耐药问题。
对于乙型肝炎来说，抗病毒治疗中干扰素适合比较年轻的，转氨酶比较高;口服的核苷类似物适用面比较广。经过长期有效的抑制病毒使肝硬化、肝癌的发生率降低，尽管很难治愈乙肝，但是可以使病人得到长期的病情稳定，使生活质量得到改善，这是目前国内外非常简要的现状。
