长期以来，实现有效抗病毒的一个重要障碍就是耐药问题。余宙耀介绍，一些患者体内的乙肝病毒发生了变异，出现耐药，乙肝病毒又重新活动起来，使病人的肝病再次加重。耐药发生后，可能导致之前的抗病毒治疗功亏一篑，并影响后续治疗的效果，除病情反弹带来的疾病负担，还会给患者造成心理、经济等方面的额外负担。
根据国内权威的统计：目前国内抗病毒治疗使用的四种核苷类药物，服用“拉米夫定”五年，耐药率约70%，其他三种也均有耐药的记录。
抗病毒药：并非人人都有效
乙肝患者在治疗过程中，“抗病毒”观念已经深入人心，但专家表示，抗病毒治疗并非对每一个患者都有效，使用抗病毒药物的病人要求有几个指征：一是肝炎在活动，转氨酶二倍左右高；二是要有病毒复制，病毒载量要比较高，一般指标是e抗原阳性者病毒载量达到10的5次方以上，e抗原阴性者病毒载量达到10的4次方以上。
国内肝炎抗病毒治疗主要是通过核苷类似物药物和干扰素。干扰素一般不会引起耐药，但经济负担重的病人“大部分还是选用核苷类似物药物。”余宙耀表示，“抗病毒治疗的目的是最大限度地长期抑制乙肝病毒，延缓、阻止疾病进展，达到各项正常指标就暂时不用抗病毒治疗。”而整个肝病的用药提倡，既要保护肝细胞，促进肝细胞再生，又要避免加重肝脏的负担，避免药物对肝脏的毒副作用。
耐药后果：肝炎易转变为肝硬化、肝癌
去年台湾地区做了一个前瞻性的研究，对乙肝患者进行13年到18年的随访观察,发现如果科学更换用药、交叉治疗后，耐药的可能性较小，检测发现DNA基本正常，这种病人发生肝硬化、肝癌较少。耐药以后，可导致DNA水平再次升高，病情严重的机率大概10多倍；余宙耀主任解释说：“DNA水平的高低与发生肝硬化和肝癌的几率有相关性。”
“我们在临床上遇见过一部分耐药的患者，不久就得了重症肝炎。”余宙耀表示，一般情况下，耐药会使肝炎一步步转变成肝纤维化、肝硬化和肝癌。
余宙耀主任提醒：“患者如果发现病毒含量再次升高、转氨酶升高这两个指标和临床症状加重的现象。就证明有可能出现耐药了。”他强调，但是，就是出现以上的几种症状，也不一定是耐药，有可能是因为到处求医吃药、饮食喝酒多、劳累、拉肚子等自身免疫出现问题而导致的。
检测发现耐药，及早调整治疗方案
目前，患者可以通过有效检测了解自己是否出现耐药，余宙耀主任告诉记者检测原理：“四种核苷类药物共7个耐药位点是恒定的，通过对病毒基因进行检测，如果某个位点的碱基排列出现问题，就证明这个位点已经耐药了。”
