一般全程疫苗打完后，一周到半月内就可以产生有效抗体，此时检查乙肝三项，就能出现抗体阳性的情况。但有的人就是查不出乙肝抗体，类似的情况，临床上时有发生。
乙肝疫苗不能有效接种，首先考虑为体内可能存在着免疫系统的某种功能障碍，造成体内无法识别此种疫苗；二是接种剂量偏小。由于个体差异，常规剂量对有的人来说可能偏小，所以不能产生抗体，因此需要加倍剂量注射；三是疫苗的免疫原性较差，人体的免疫系统不易识别它，因而也不能产生有效的抗体；四是免疫功能先天或后天的缺失。如某种疾病可以导致后天性的免疫功能缺失(如艾滋病等)，也不能产生抗体。
特别是婴幼儿，在出生后注射乙肝疫苗后，家长切不可掉以轻心。注射乙肝疫苗是目前预防乙型病毒性肝炎的有效措施。许多家长认为，只要给孩子注射了乙肝疫苗，就万事大吉，不会受传染了。这种想法是片面的。
经临床验证，乙型肝炎疫苗预防乙肝是非常安全有效的。儿童在0-1-6程序接种(即新生儿出生后6小时内注射20-30微克乙肝疫苗，1个月和6个月后分别再注射10微克疫苗)后的免疫效果持续时间较为长久，免疫力一般至少可维持4-5年。到4周岁时检测，若发现滴度下降，则需再加强注射一次，就可以产生较高抗体。据研究，以下许多因素都可影响乙肝疫苗的预防效果。
1.被动吸烟：调查发现，被动吸烟的儿童体内抗体水平下降较快。
2.肥胖：专家认为，接种乙型肝炎疫苗后，肥胖儿童感染乙型肝炎的几率是正常儿童的3.5倍。
3.挑食：挑食的儿童常常有某些营养缺乏，使机体免疫反应功能降低，体内产生的抗体有限，因而易受乙型肝炎病毒的感染。
以上因素都是儿童在成长过程中稍不注意就容易出现的，希望家长们密切注意。
