甲型肝炎（简称甲肝）潜伏期平均约30天。
多以发热起病，类似"感冒"症状，平均发热3天左右。常伴随有恶心，呕吐，厌油食等类似"胃炎"表现。随之出现尿色深红如隔夜茶色，皮肤粘膜发黄，粪便颜色变浅。化验检查出现血清胆红素和谷丙转氨酶（salt）明显增高；病情常呈自限性，预后良好，大多数（80%以上）在3个月内临床症状消失，肝功能恢复正常。
6个月内完全治愈。无转为慢性肝炎的倾向，无甲肝病毒慢性携带者。极少出现重型肝炎。如无症状hbsag携带者重叠甲肝感染，其临床表现及病程与单纯甲肝相似。但基础病为慢性乙肝或肝硬化则可能加重病情。
甲肝病毒主要存在于甲型肝炎患者或隐匿性感染者的粪便中，排毒或长至2～3周，在潜伏期末和发病初期大量排毒。因此，甲型肝炎潜伏期后期及黄疸出现前数日传染性最强。当黄疸高峰后逐渐消退时，病情好转，传染性亦减弱。一般黄疸出现后两周，虽部分患者粪便中仍可极出病毒颗粒，但实际传染性明显下降；黄疸出现后3周时，患者粪便中已很难找到甲肝病毒，此时基本上无传染性。
近年有人认为，急性甲型、乙型肝炎患者同住一室，对其出院的乙型肝炎患者进行随访观察，未发现交叉感染甲型肝炎的现象。因此，对黄疸消退后的甲型肝炎患者，已无需再行严格限制或隔离。但为了最大限度地防止甲型肝炎病毒扩散，我国规定对甲型肝炎患者采取隔离措施，自发病日起不少于30日。
