丙型肝炎病毒对肝脏的破坏是持续、隐匿、不可逆转的，百分之八十以上的感染者将发展成慢性肝炎，丙肝患者最终发展成肝硬化、肝癌、肝衰竭的比例也远远高于其他肝炎。丙肝病毒还会加重其他肝炎患者的病情。由于至今没有研制出丙型肝炎疫苗，丙型肝炎的危害从某种意义上说比乙肝更为严重。
为减少丙肝带来的危害，一方面要大力普及丙肝预防知识，使人们避免感染丙肝病毒；另一方面应在丙肝高危人群中开展丙肝抗体检查，以使丙肝病人及早得到诊断和治疗。有多个性伙伴者，有输血史或使用静脉注射毒品者，以及经常可能接触血液的医护人员、美容师、牙医、警察等，都应该考虑接受丙肝抗体检查。
目前，干扰素被认为是治疗丙肝唯一有效的药物。然而在临床治疗中干扰素只对百分之十至百分之二十的患者有效。
干扰素在血液循环中存在的时间很短，不能保持有效的抗病毒浓度，患者需要一周三次或隔日注射一次，注射后短时间内干扰素血液浓度会很高，但在两次注射之间干扰素浓度很低，影响了它的疗效。
另一个重要原因是病人可能携带有不同基因型的丙肝病毒，不同基因型的丙肝病毒对干扰素表现出不同的抵抗能力。研究表明，中国和美国百分之八十以上的丙肝患者携带基因一型病毒，而苏格兰和英国患者携带的病毒则以基因三型为主。
