乙肝口服抗病毒治疗过程中，耐药是一个令人头疼的困扰。有关专家指出，乙肝耐药是一个动态过程，临床上可分为基因耐药、病毒学耐药和临床耐药三个阶段。
专家指出，不是所有乙肝病毒变异都会导致耐药，只有针对药物产生的病毒变异才能引起耐药。
如果乙肝病毒发生变异，首先会进入基因耐药阶段，此时乙肝病毒为了逃避药物打击变身成“变异株”，但由于“变异株”数量少，所以临床上病毒水平既没有上升、肝功能也正常。基因耐药不太容易发现，因为它没有任何的临床症状。
耐药的第二个阶段是病毒学耐药，此时乙肝病毒的“变异株”越来越多，乙肝病毒基因(HBV DNA)水平上升，但转氨酶仍然维持正常水平。如一些乙肝病人经过口服抗病毒治疗后，HBV DNA水平出现转阴，但是治疗6个月以后，HBV DNA水平出现反弹，这就有可能就是病毒学耐药。
如果病毒学耐药阶段不采取措施，病毒继续增加，就可能出现临床耐药。此时，患者转氨酶升高，炎症坏死，病情加重。
在乙肝治疗过程中，HBV DNA水平和肝功能是判断是否耐药的关键。因此，乙肝患者要对这两大指标进行定期监测。专家指出，虽说乙肝治疗是一个长期的过程，但并不意味着开始吃药以后就可以不管了。治疗时如果不做病毒和肝功能的检测，容易错过调整治疗方案时机，而一旦发生临床耐药就会非常危险。为管理耐药和提高疗效，乙肝患者应在开始抗病毒治疗的前三个月，每月检测一次HBV DNA和肝功水平；此后，每三个月检测和随访一次。
