HBV—DNA称为乙肝病毒脱氧核糖核酸。病毒从结构上分为两类一类是RNA病毒(核糖核酸病毒)，另一类是DNA病毒(脱氧核糖核酸病毒)，乙肝病毒属于后者。病毒与细菌不同，细菌体内含有两种核酸(RNA和DNA)，而病毒体内只含有一种核酸，或RNA或DNA。核酸是病毒的核心部分、病毒的基因都在这里，没有核酸，病毒就不能复制。因此，检测HBVDNA是判断乙肝病毒有无复制的“金指标”。有人会问，检测乙肝“二对半”已能反映乙肝病毒有无复制、有无传染性，为何还要检测HBVDNA呢？这是不是重复检查，增加了病人的负担？可以肯定，检测HBVDNA是必需的，不是重复检查，原因如下：
1.如果乙肝病人是“小三阳”，一般说这是乙肝病毒进入非复制状态，传染性消失或很低，病情也应当趋于稳定。但实际情况并非如此，有时病人的转氨酶仍然反复波动，甚至出现黄胆，这是怎么回事？经检测HBV—DNA发现其为阳性，可以肯定，病毒仍复制活跃、病情不稳定与乙肝病毒活跃有关。“小三阳”乙肝因其HBeAg阴性，被医生称为“HBeAg阴性肝炎”，是这由于病毒“变异”造成的，故也称“异型乙肝炎”。对此型乙肝不能掉以轻心，病情可能更重。
2.在检测病人“二对半”时，仅发现其中1项阳性，如HBsAg阳性或单一的抗—HBc阳性，这并不能说明病人体内的病毒有无复制，必需检测HBV—DNA，一旦阳性、就可肯定仍有病毒复制、也有传染性。
3.有一些肝炎病人的“二对半”5项全部阴性，甚至甲、丙、丁、乙型肝炎病毒标志物也是阴性，但病人的转氨酶却很高，有黄疸，肝功能损伤明显、这是怎么回事呢？通过测HBV—DNA后，可能发现为阳性，就此可断定这种肝炎叫“慢性隐匿性乙肝”，在不明原因的肝炎中，此类型肝炎约占30一60%。
4.有的乙肝病人竟被检测到抗—HBs，这是保护性抗体，它的阳性说明感染结束，但为什么病人的病情依旧，并无好转迹象？如HBV—DNA阳性，问题又解决了，这叫“抗—HBs阳性乙肝”，也是病毒变异惹的祸。
HBV—DNA检测与乙肝标志物的关系
1.HBV—DNA与大三阳
HBV—DNA和大三阳基本上是一对一的关系，也就是说HBeAg存在的时候，HBV—DNA都是阳性的，所以说HBeAg阳性，就意味着乙肝病毒存在，代表着有传染性，说明病毒复制最活跃，提示母婴垂直传播机率最高，暗示发生肝炎、肝纤维化、肝硬化、肝癌的可能性最大，所以说大三阳时一定要积极治疗。但大三阳不能具体反映出乙肝病毒的数量，而且有时HBeAg阴转了，但HBV—DNA仍为阳性，所以治疗大三阳时一定要查HBV—DNA。一个HBV—DNA的存在，就标明一个完整的乙肝病毒的存在。如果大三阳转为小三阳，HBV—DNA<1000Copies/ml，肝功正常，就可以说大三阳基本治愈了。
2.HBV—DNA与小三阳
HBV—DNA阳性时，小三阳表明仍有传染性，与大三阳相比，仅意味着乙肝病毒的量少一些，病毒复制弱一些，母婴垂直传率低一些，将来发展成肝炎、肝纤维化、肝硬化、肝癌的可能性小一些，所以小三阳HBV—DNA阳性时也一定要治疗。有时HBV—DNA阳性，小三阳患者肝功明显异常、自觉症状较重，这时意味着乙肝病毒已发生了基因变异，或又感染了新的乙肝病毒，病情有恶化趋势，一定要加倍治疗或更换药物。HBV—DNA阴性时，小三阳常表明传染性消失，个人健康影响减少，可以婚育，但不能排除肝细胞内整合的HBV—DNA的存在，所以仍有引发肝炎、肝硬化和肝癌的可能，这就是小三阳HBV—DNA阴性时仍需治疗的理论基础。
3.HBV—DNA与三抗、二抗、一抗
三抗指的是抗-HBs(+)、抗-HBe(+)、抗-HBc(+)，大多情况下表明乙肝病毒感染已进入恢复期，已没有传染性，已有一定的免疫力，但HBV—DNA阳性，仍有感染性，仍需治疗，这种情况也多为乙肝病毒基因变异所致。
二抗：抗HBe和抗HBc阳性时，HBV—DNA有时仍可阳性，但抗HBs和抗HBc阴性时，则HBV—DNA常为阴性，表示对既往感染的免疫。
一抗：单独抗HBe、抗HBc，甚至抗HBs有时HBV—DNA仍为阳性，提示E系统或S系统的转换后，HBV—DNA并非完全消失，所以HBV感染以E系统来划分病毒复制与否，以S系统转换划分恢复与否并非完全合适，而以HBV—DNA的存在与否来划分病毒复制及其是恢复最为准确，也只有通过观察HBV—DNA才能准确掌握药物抗病毒的疗效。
HBV—DNA的检测和选择
HBV—DNA的检测分为定性和定量两种。定性检测HBV—DNA的阳性或阴性结果只能反映病毒基因的有无，只有定量检测才能显示出病毒量的变化。定量检测有杂交法和酶联扩增法两种，目前我们临床使用的大部分是酶联扩增法，即PCR法，这种方法比杂交法要敏感的多。
