肝癌根治性切除后5年内累计复发的患者可超过半数，因此，防止复发非常重要。肝癌手术后给予辅助治疗的目的就是降低术后复发的风险。
肝动脉栓塞化疗是术后主要的辅助治疗。不过，肝动脉栓塞化疗本身对肝功能有一定的损害，因此，国内外对肝癌根治性手术后是否应该用辅助性的肝动脉栓塞化疗有争议。现在一般认为，对于那些术后复发风险大的患者，还是应该做1～2次肝动脉栓塞化疗。如果是小肝癌，也没有血管侵犯，而且是单个的结节，也不一定在术后做辅助性的肝动脉栓塞化疗，特别是那些肝硬化比较严重的小肝癌，术后还是慎用肝动脉栓塞化疗的。
临床试验结果证实，根治性手术后应用干扰素能降低术后复发率。干扰素不良反应相对较小，多数患者能够耐受，通常需要应用1～2年。现在研究表明，检查术后切除的肝癌标本，如果一种叫P48的蛋白阳性，则干扰素应用的效果更好。
目前一般不主张术后给予全身性的化疗，因为肝癌对传统的化疗药物不敏感。没有证据表明全身性的化疗对预防术后复发有效，且全身化疗不良反应大，对肝癌切除后的患者而言，恐怕是弊大于利。
