甲型肝炎患者和肝炎的隐匿被感染患者者的粪便中都有甲肝病毒，一般病毒的存在时间会有二到三周，病毒在潜伏期末及发病早期的排毒量十分大。因此，甲型肝炎潜伏期后期及黄疸出现前数日传染性最强。当黄疸高峰后逐渐消退时，病情好转，传染性亦减弱。
一般黄疸出现后两周，虽部分患者粪便中仍可极出病毒颗粒，但实际传染性明显下降；黄疸出现后3周时，患者粪便中已很难找到甲肝病毒，此时基本上无传染性。近年有人认为，急性甲型、乙型肝炎患者同住一室，对其出院的乙型肝炎患者进行随访观察，未发现交叉感染甲型肝炎的现象。
因此，对黄疸消退后的甲型肝炎患者，已无需再行严格限制或隔离。但为了最大限度地防止甲型肝炎病毒扩散，我国规定对甲型肝炎患者采取隔离措施，自发病日起不少于30日。
凡是未感染过甲型肝炎病毒的人，无论是儿童还是成人均是易感者。但由于甲肝病毒感染与社会经济状况及个人卫生习惯密切相关，故在我国，15岁以下的儿童及青少年最容易患甲型肝炎，因为病后获得了持久的免疫力，至成年时，患甲型肝炎者减少，老年人更少。
甲型肝炎一般来说预后很好，较易恢复，是一种自限性疾病。在托儿所和幼儿园中，感染甲型肝炎的儿童出现临床症状者不多，发生暴发性肝功能衰竭等症者更少。回顾世数据表明，临床黄疸症状及病死率均随年龄增长而上升，儿童低于青壮年，更低于老年人。目前绝大多数学者认为，甲型肝炎少数病例虽可发生临床、生化指征的迁延复发，病理检查的慢性化，但不会成为慢性肝病。唯6个月以内的幼婴发生甲型肝炎者病情较重，死亡率明显高于年长儿。有报道住院的半岁以内甲型肝炎占儿童甲型肝炎重型的70%，病死率约50%左右；另外老年人（60岁以上）的甲型肝炎患者发生重型和并发症的也多，病死率10%，但无论老幼，由甲型肝炎引起肝硬变者甚罕见。
