甲肝病毒的潜伏期最短15天，最长45天，平均30天。感染了甲肝病毒后，有相当一部分人，可没有任何症状，甚至肝功能检查也正常，而到恢复期却可产生甲型肝炎病毒抗体。另一部分人经过2~6周的潜伏期后才出现临床症状，但不同的人临床表现可有不同。根据甲肝临床症状轻重不同急性黄疸型与急性无黄疸型。
（1）急性黄疸型甲型肝炎的临床过程甲肝可分黄疸前期、黄疸期、恢复期三个阶段，一般总病程约2~4个月。
黄疸前期：病人大多急性起病，有畏寒发热、全身乏力、肌肉酸痛、食欲不振、恶心呕吐、腹痛腹泻、及腹胀等症状。亦有少数患者并无明显黄疸前期症状而直接进入黄疸期。可有肝区压痛及触痛，皮疹，尿胆红素阳性，肝功能检查ALT升高，抗HAV—IgM阳性等症状。
此期短者2~3天，长者2~3周，平均5~7天。黄疸期：各种典型症状和体征先后出现，年色逐渐加深，继而巩膜黄染，皮肤逐渐变黄，约于1~2周内达高峰，此时可有短期大便颜色变浅，皮肤瘙痒，心动过缓等现象。
约在2-3周内恢复正常65%患者肝肿大至肋缘下1~3cm，可有轻度脾肿大。整个黄疸期持续2~6周，也有短者2天，长至95天或更长者。恢复期：黄疸消退而临床上症状减轻以至消失。此期持续时间2周至4个月不等，平均1个月左右。90%以上的病人在起病后半年内完全恢复。
（2）急性无黄疸型甲型肝炎：
为临床最常见的类型，占急性肝炎病例的90%以上。其临床症状较轻，仅表现为乏力、食欲减退、腹胀和肝区疼痛等症状，少数病人有发热、恶心、腹泻等症状。体征以肝肿大为主，脾肿大为少见。
相当多的病人仅有体征和肝功能改变，在普查时才被发现。一般3个月内恢复正常。有的人无症状，转氨酶只有短暂升高后即恢复正常，或根本不升高，而只有抗甲型肝炎病毒免疫球蛋白M（IgM）抗体1：4000以上阳性，到恢复期IgM抗体消失，代之以抗甲型肝炎病毒免疫球蛋白G（IgG）抗体阳性。
