（1）原发性肝癌：多有长期乙型肝炎病史，最常见的症状为肝区疼痛，伴有肝硬化门脉高压征象者可有腹水、呕血、黑便。肝癌肿瘤标志物甲胎蛋白（AFP）具有重要诊断价值。肝穿刺活组织检查有确定诊断意义。
（2）肝脓肿：细菌性肝脓肿多有突发寒战、高热及肝区疼痛、压痛、叩击痛。白细胞明显升高。B型超声波检查时可见肝脏液性暗区内有随体位移动的絮状回声波或组织碎片反射波，暗区周围肝组织有不同程度肝组织炎症反应。脓肿穿刺可抽出黄白色脓性液体，肝组织为化脓性病变。阿米巴肝脓肿多有长期不规则低热伴肝区疼痛，常伴痢疾病史。新鲜粪便检查可见阿米巴滋养体或包囊。B超引导下脓肿穿刺抽出果酱色无臭脓液有重要诊断价值。
（3）肝血管瘤：因肝囊肿为囊性，内不含血管，故通过肝动脉造影、CT增强扫描、ECT检查并不难鉴别。CT增强扫描示早期病灶边缘呈高密度强化，增强区域进行性向中心扩展。ECT检查示局限性充盈缺损，灌注期活动性正常或减少，而后期活动性增强。
（4）肝包虫病：多有牧区居住史，或牛、养、犬接触史，血嗜酸粒细胞升高，包虫囊液皮内试验（Casoni试验）和补体结合试验阳性，B超可见较厚的纤维性囊壁内有虫体样物质或子囊分隔。根据以上几点，不难与肝囊肿鉴别。
