肝囊肿一般是没有症状的。当囊肿长大到一定程度，可能会压迫胃肠道而引起症状，如上腹不适饱胀；也有因囊肿继发细菌感染而有腹痛、发热的。随着影象诊断学的发展及普及，尤其是B超已列为人群体格检查的常规之一，而B超对肝囊肿的检出率可达98%，所以发现本症的不少。在人们的心目中，囊肿是在肝脏上面长出来的一个肿瘤，尽管没有多大的症状，也很不放心，肝囊肿常见的并发症是破裂出血、细菌感染、瘘及穿透，而罕见癌变。先天性肝囊肿是绝对不会癌变的。
肝囊肿大多是先天性的，有的单唯一个，也有多个的，然而多发性肝囊肿病人有时还合并其他内脏的囊肿，如伴发肾囊肿、肺囊肿及偶有胰囊肿、脾囊肿等。肝囊肿的危害有那些多囊肝的囊肿可满布肝脏，有些病人常以上腹肿块为首发症状，终末期出现腹水，门脉高压等肝功能不全的症候。肝囊肿一般是没有症状的。当囊肿长大到一定程度，可能会压迫胃肠道而引起症状，如上腹不适饱胀；也有因囊肿继发细菌感染而有腹痛、发热的。
