囊肿生长缓慢，多数肝囊肿患者长期甚至终身无任何症状，肝功能试验大多正常，故多数在体检或因其他疾病就诊时查肝脏b超而于无意中发现。肝囊肿的症状与囊肿的大小、数量、位置及是否对邻近器官有推移、压迫及有无并发症等有关。
一般说来，有症状的囊肿直径多在10～15厘米以上，常见的主要是消化道症状：消化不良、食欲减退、腹胀、嗳气、恶心、呕吐、右上腹痛等，系大囊肿对胃肠道压迫所致。若继发感染，则出现寒战、发热；若压迫胆总管或肝管可致黄疸，有血清胆红素、碱性磷酸酶、转氨酶的升高；少数可因囊肿破裂、囊肿内出血引起腹膜炎，临床上出现剧烈腹痛及腹膜刺激症等急腹症表现。
若合并有肾囊肿，可因肾脏损害在疾病后期产生高血压、血尿、蛋白尿及肾功能减退等系列表现。部分多囊肝病患者有较明显的肝肿大，患者可在平卧时自行扪及右上腹肿块。
