1、细菌性肝脓肿
病急，多有寒战及弛张型高热，体温可达39～41℃；肝区或上腹部疼痛，有时牵涉肩部；肝脏肿大位于肋缘下时触痛明显，肋间多有固定压痛区域；白细胞计数升高，可有核左移；血细菌培养半数阳性；B超：呈蜂窝状低回声网状结构或液性暗区，病变边缘多模糊，回声粗糙、不规则；CT：呈圆形或类圆形低密度区，密度虽与囊肿相似，但静注造影剂增强后，脓肿周围一般均有强化，形成增强环，多房性的囊肿其分隔亦被增强；病变周围若出现靶征或双靶征，为特征性的肝脓肿CT表现。B超引导下诊断性穿刺抽得有臭味的脓液可确诊。
2、阿米巴肝脓肿
起病多缓慢，病程长，低热，发病前可有痢疾史，肝脏肿大较显著且压痛明显；血清免疫试验阳性；B超、CT等影像学表现类似细菌性肝脓肿；B超引导下诊断性穿刺抽得巧克力样脓液可确诊。
3、肝包虫病
患者多来自牧区，起病缓慢，常有上腹部部位不定的隐痛，上腹部包块质地不一，可呈囊性感或质韧；有时可扪及有特征性的包虫囊震颤征（hydatid thrill）；血象可表现为嗜酸性粒细胞增多；间接血凝试验、补体结合试验阳性，皮内过敏试验阳性率更高，但亦有相当多的假阳性；B超：病变囊壁多呈双层结构，壁较厚，囊腔内可有大小不等的圆形暗区（子囊），如在圆形暗区内又含小的圆形暗区（大囊套小囊），则为包虫病的特征表现，内囊脱落时可见囊腔内水上睡莲征；CT：囊壁呈密度略高的环状阴影，多数囊肿可见密度较高的母囊和密度较低的子囊同时存在于囊腔内，为肝包虫病的特征性表现。
4、含囊性病变的肝脏肿瘤
主要靠影像学诊断来鉴别：①肝脏囊腺瘤或囊腺癌：B超下见无回声区为主的囊腔，但囊壁不光整，某一局部有乳头状相对强回声突入囊腔内，如为恶性，则随访可见腔内可出现不规则的絮状团块状的实质性结构回声，逐渐充满囊腔，转变为囊实混合性的非均匀杂乱回声；②转移性肝癌和部分原发性肝癌出现病灶中央液化坏死时，B超可见在增强光团区周围有一层低回声暗圈包绕，而光团的中央呈现另一无回声或低回声区，即所谓的靶征或牛眼征（bull eye sign）。
5、肝外腹腔其余部位的囊肿
巨大肝囊肿有时需与胰腺囊肿，胆总管囊肿、肾积水、肠系膜囊肿、巨大卵巢囊肿等相鉴别，一般通过询问病史、体格检查、B超、CT等，不难鉴别。
