肝囊肿分为寄生虫性与非寄生虫性两大类，而肝脏非寄生虫性囊肿病，以先天性囊肿最为常见，亦称为肝囊肿。先天性肝囊肿又称为真性囊肿，以区别创伤性、炎症性、肿瘤等引起的假性囊肿。通常所称的肝囊肿多为先天性的良性肝囊肿。
肝囊肿可分为单发性与多发性囊肿（多囊肝）。单发性肝囊肿较少见。本病多见于女性，男女之比为1：4。对于直径小于5cm的肝囊肿，又无症状者，不须治疗，而直径大约5cm的囊肿容易并发破裂、出血、感染。特别有临床症状者应给予手术治疗。
目前国内外医学界一致认为肝囊肿大于5cm，需进行外科治疗（原因是囊肿不会缩小而会继续增大，压迫周围肝组织，使其发生萎缩，易并发破裂、出血、感染）。
现代肝囊肿外科治疗方法有三种方式：
1、腹腔镜肝囊肿开窗引流术
此手术是现代国内外治疗肝囊肿最常用的手术方式，其特点是：既达到彻底开窗引流的目的，又可避免剖腹手术和反复穿刺带来的并发症，且手术创伤小、出血少、恢复快住院时间短，是目前治疗肝囊肿首选最佳的方法。腹腔镜肝囊肿开窗引流手术，目前已是肝胆外科相当成熟的手术方式，应用广泛，有条件的医院均能进行手术，它对于向肝表面突出的较大的肝囊肿更为适用，它使肝囊肿开窗引流手术从过去的大切口、大创伤转变为微创化，使开窗引流达到最佳化。
2、剖腹行囊肿开窗引流或囊肿切除术
此手术方式是传统的开腹手术，它切口长、创伤大、出血多、恢复慢，同时还可能具有开腹手术的常见并发症。但是引流良好。是较传统的手术方式，也是治疗肝囊肿的主要手术方式之一。由于它是有创而且是大创的手术方式，目前已少用，仅在一些需要同时处理其他病变时应用。
3、B超引导下肝囊肿穿刺抽液无水酒精注射术
此手术创伤虽小但需反复穿刺抽液，具有复发及感染的可能。仅用于体质较弱的老年病人和伴有其他重要器官疾病的病人。治疗不彻底。同时无水酒精的囊内注入可能外渗损伤周围组织。发生严重的并发症。目前已基本不应用。
手术后常见的并发症：
与开腹手术的并发症一致如术后发热（多为低热(正常人的体温，口腔温度一般为35.8～37.4℃。在正常状态，正常人的体温不应高于37.5℃）、出血、胆漏、感染等。但不具有开腹手术的其他腹腔内的并发症。
术后注意事项：
术后第一天可进食全流饮食，并可适当下床活动，第二天饮食恢复正常。观察引流管引流情况。无并发症的前提下。病人在术后的五天可出院。
