肝癌与肝囊肿似有相似之处，因为肝癌也属于肿瘤，和肝囊肿有些相似，有些人会把二者混淆，其实肝癌与肝囊肿的区别很大，这是两种完全不同的疾病，肝癌为恶性，肝囊肿为良性疾肝癌与肝囊肿似有相似之处，因为肝癌也属于肿瘤，和肝囊肿有些相似，有些人会把二者混淆，其实肝癌与肝囊肿的区别很大，这是两种完全不同的疾病，肝癌为恶性，肝囊肿为良性疾病。
肝肿瘤（主要是肝癌）与肝囊肿要分清的，不诊断清楚就盲目治疗是不恰当的！因为如果是肝癌，早期在肿块比较小（小于5cm）的情况下，也要尽可能手术，还要治愈可能，如果肿瘤较大，不是孤立的可以考虑用无水酒精注射，无水酒精注射的原理是酒精让肿瘤组织凝固坏死，一般只是姑息治疗的手段，很难治愈肝癌。 而肝囊肿是良性肿瘤，可以不做任何治疗，即使要治疗也可以通过手术切除，而不是介入治疗。
对于大多数患者来说，其所患肝囊肿均为小的肝囊肿，对这些体积小的肝囊肿，无论先天或后天，无论表浅或深在，无论有无症状，无论数目多少，均不要紧，不需要处理。肝囊肿与肝血管瘤一样，不长大、不恶变，对患者无威胁。
肝癌和肝囊肿在临床上的处理也截然不同。囊肿一般是静止的，不需要处理。而肿瘤有进行性生长的特性。恶性肿瘤（肝癌或肝肉瘤）还有侵润及转移的特性。因此，对肿瘤应积极治疗。
另外应该警惕的是，肝癌与肝囊肿可合并存在，肝癌伴发肝囊肿并非罕见。因此，临床医生和病人不要满足于肝囊肿的诊断，还应时刻保持对肝癌的警惕性肝囊肿大多生长缓慢，可长期或终生无症状携带，且不会发生癌变，一般不会危害生命，但少数可因囊肿破裂、出血而出现急腹症；而肝癌瘤体生长速度相对较快，较易出现并发症，病死率较高。
