第一：如果小三阳DNA检测呈阴性，肝功能、B超等均长期正常，说明病毒已不复制，无传染性，所以无需隔离与治疗。这种情况约占小三阳 患者总数的60%--70%，目前国内外尚无进一步治疗的方法。一味追求转阴而服用大量治疗性中西药物只会增加肝脏负担，甚至招致不良后果。
第二：小三阳还有一种表现为乙肝病毒 DNA 低水平复制（PCR 检测< =106，肝功能正常或轻度异常，腹部 B超脾稍厚，称为慢性乙肝病毒残留期。这种情况约占小三阳患者总数的20%，目前国内对此种患者最容易忽视。如果不积极治疗，任其发展，可导致肝硬化、肝癌。
第三：最严重的是乙肝病毒DNA高水平复制（PCR 检测>106），肝功能不正常，称为“e 抗原阴性的慢性乙肝 ”。这种情况约占小三阳患者总数的10%，它的特点是病毒复制活跃，传染性强，是由于乙肝病毒变异所致。
这种小三阳反而比三大阳严重，其转化为肝硬化、肝癌的几率更高。在治疗上可采取免疫疗法与抗病毒药物相结合 ，促使乙肝病毒 DNA 转阴，肝功能恢复正常，而不应仅仅是护肝降酶这种治标不治本的“ 姑息疗法 ”。
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