耿兰书学医行医30多年来，为了降服各种肝病，带领医院科研专家组，把中医内科治疗的知识和经验，用于肝病的治疗过程，通过刻苦研究和大量的临床实践，进行了上万次科技攻关、上万次临床实验，以临床促进科研，以科研带动临床，以医带药，以药促医，先后攻克了十多项省、部级科研课题，每年都有课题获奖。
耿兰书以医带药、以药促医，将拜师学医获得的祖传验方“无黄疸肝炎药丸”经多年创新发展，研制出“肝复欣胶囊”系列方药，通过益气养血，健脾补肾，佐以清热解毒为主要思路的配方，能调节免疫功能，调整蛋白比值，保肝抗病毒。“无黄疸肝炎药丸”与他创新研制的健脾补肾、清热解毒、滋阴合血的“益肝泰胶囊系列方药”或与“丹参强肝系列方药”复方治疗，能调节免疫功能，保肝抗病毒、抗纤维化，明显提高了对于乙肝、丙肝的治疗疗效，同时防止和减少了肝硬化的出现。
“肝复欣胶囊”系列方药与耿兰书创新研制的用于软肝软脾、理气利尿的“消臌软坚丸”复方治疗，能提高患者的白蛋白，降低球蛋白，在软肝缩脾的同时，迅速消除大量胸腹水，疗效甚佳，得到国家局领导的表彰并予推广。
“肝复欣胶囊”系列方药与耿兰书创新研制的用于软肝软脾降低门脉高压的“双甲软坚胶囊、通络软坚胶囊、缩脾胶囊”复方治疗，能益气养血，调整蛋白比值，同时能把硬化的肝脏治软，把肿大的脾脏治小，把扩张的门静脉降低，使肝硬化得到逆转。
“肝复欣胶囊”系列方药与耿兰书创新研制的用于软肝软脾，软瘤、抗癌的“克岩胶囊”复方治疗，能改善患者的体症，消除或控制肿瘤的发展，消灭血液中的癌细胞，提高患者的生存质量，明显延长肝癌患者的生命。
耿兰书秉承传统中医药之精髓，将拜师学医获得的祖传验方“缩脾丸”、“治黄肝炎丸”加以修改，科技创新形成了目前的院内制剂“缩脾胶囊”、“舒清丸”。“缩脾胶囊”专门用来治疗巨脾，配合“通络软坚胶囊”或“双甲软坚胶囊”治疗肝硬化、脾肿大、门脉高压增强了疗效。“舒清丸”是重点治疗急慢性肝炎、肝硬化、肝衰竭高黄疸的特效良药，“舒清丸”的疗效明显高于辨证施治的治黄汤药，而且好服用、好携带、药价低。
耿兰书多年来通过反复学习和临床实践，吸取了肝病大师关幼波和江春华教授治疗肝硬化的理论精华，加上个人多年来的研究，科研创新，确立了以“益气养血、活血化瘀、化痰散结、疏肝通络”方为治疗肝纤维化、治疗肝硬化的基本准则，认为“益气养血结合活血化瘀法比单纯活血化瘀效果要好，疏肝通络结合活血软坚药的运用，比单纯活血软坚对缓解门脉高压效果更佳”。
耿兰书创立“中医肝病”的品牌,充分突出中医特色,走中西医结合之路，建立了现代化的制剂室，发展新方药，为了提高患者的治愈率，提高对危重患者抢救的成活率，减少死亡率，减少复发率，科研带动临床，临床促进科研，承担了省部级多项科研课题，先后研制开发出43种治疗各种肝炎、肝硬化及合并症的特效方药，35种治疗各种急慢肝炎肝硬化及其合并症的中药制剂已经获得了河北省药监局的批准文号。同时针对临床中突出的病症、体征，耿兰书拟定了72个汤药协定处方，通过口服或高位保留灌肠及低位保留灌肠辩证施治。
例如对临床上以黄疸为主要表现者辨证分型治疗：湿重于热（用茵陈、栀子、田基黄、茯苓、苏梗、车前草、藿香等）、热重于湿（用茵陈、黄柏、田基黄、赤芍、生大黄、炒枳壳、白茅根等）、湿热并重（用茵陈、栀子、茯苓、炒枳壳、生大黄、黄柏）、阴黄证（用茵陈、白术、田基黄、苏梗、炙甘草、附子等）、瘀胆型（用茵陈、赤芍、生大黄、丹皮等）和体用同调方（用生黄芪、北沙参、白芍、赤芍、郁金、茵陈、苡仁等）分别进行辨治。治腹水汤剂，包括肝郁脾虚、气滞水停证、脾虚水泛证、气阴两虚、水湿内停证等以及针对血性腹水、胸水汤药等，药选黄芪、鳖甲、泽兰、车前子、沉香、茯苓皮、大腹皮、桑白皮等益气健脾、活血软坚、行气利水。对肾功能不全者，予大黄、牡蛎、蒲公英、泽泻等高位保留灌肠，通腑泄浊、解毒利水，以使淤毒分消走泄；对肝性脑病者，予大黄、赤芍、蒲公英、冰片等低位保留灌肠，以清热解毒、清营开窍。对脾功能亢进、巨脾患者，耿院长在民间验方上加以改进，研制了“缩脾胶囊”（丝瓜络、守宫、泽兰等）化痰解瘀，疗效确切。
耿兰书为了提高医疗质量，挽救一个个危重患者的生命，提高患者的生存质量，在努力创拟新方药的同时，不断科技创新，创立新疗法。耿兰书独创了治疗乙肝、丙肝、脂肪肝、脾肿大、肝硬化、肝昏迷、高黄疸及顽固性腹水的5套特色疗法（即治疗肝炎、肝硬化的“中成药复方疗法”，治疗慢性乙型肝炎的“复方同步疗法”、“两步疗法”、“中西医结合三联法”，治疗脾功能亢进、巨脾及肝脏肿瘤用“中西结合介入疗法”），在治疗各种肝炎、肝硬化、胸腹水、肝癌、门脉高压、脾大、重症肝炎、脂肪肝、胆囊炎、胃病及其合并症等方面取得突破，不仅使肝病患者得到更规范化、系统化的治疗，解决临床疑难病例的治疗，以提高疗效，提高危重患者的生存率。治疗中，通过双处方或多处方多靶点中西结合，联合用药，辨证施治，取得了神奇疗效，先后将几十万名濒临死亡的肝病患者从死神中夺了回来。
