肝的生理功能非常复杂，因此肝功能正常指标也很多，每项指标都有各自的意义，通过肝功能正常指标的数据结果来进行分析，判断人们是否患有哪种肝病。指标的上下波动也各有含义，代表患病程度不相同。
反映肝细胞蛋白合成代谢功能的指标：总蛋白（TP）、白蛋白（ALB）、前白蛋白（PA）、胆碱酯酶（CHE）、凝血酶原时间（PT）。由于它们都是由肝脏合成的，一旦肝脏合成功能下降，以上肝功能正常指标在血液中浓度随之降低，其降低程度与肝脏合成功能损害程度呈正相关。反映肝细胞有无受损及严重程度的肝功能正常指标：谷丙转氨酶ALT（GPT）、谷草转氨酶AST（GOT）、腺苷脱氨酶（ADA）、胆碱酯酶（CHE）、乳酸脱氢酶（LDH）等。以上各项酶在肝细胞中均有存在，当肝细胞膜受损或细胞坏死时，这些酶进入血清便增多。通过测定血清或血浆中酶的活性，肝功能正常指标即可反映肝细胞受损情况及损伤程度。反映肝脏胆排泄、分泌及解毒功能的肝功能正常指标：总胆红素（TBIL）、直接胆红素（DBIL）、总胆酸（TBA）、血氨（NH3）。
肝细胞损害时，其排泄、分泌、运输及解毒功能出现障碍，造成血液中TBIL、DBIL、TBA和NH3浓度升高。对诊断胆汁淤积指示酶（包括同工酶）有帮助的肝功能正常指标有：碱性磷酸酶（ALP）；r谷氨酸转肽酶（GGT）、5′-核苷酸酶（5′-NT）等，以AKP及γ-GT应用较多。这些酶在肝内胆管上皮层的浓度较高。当上皮层受损及胆管内压力增高时，便有这些酶增多进入血清中。反映肝脏间质成分增生（肝纤维化和肝硬化）的肝功能正常指标：胶原或其末端多肽——Ⅲ型前胶原氨基端肽（PⅢP）、Ⅲ型原胶原（PCⅢ）、Ⅳ型胶原C端原肽（Ⅳ/PC）；糖蛋白——层黏蛋白（LN）；蛋白聚糖——透明质酸（HA）。对肝肿瘤诊断有意义的血清标志物：甲胎蛋白（AFP）。
