1、肝功能异常会引发各种病毒性肝炎（甲肝、乙肝、丙肝等）、脂肪肝、肝硬化、肝癌等，这是最为常见的肝功能异常的并发症。
2、肝功能异常可导致血液循环障碍，如慢性心力衰竭时，引起肝淤血和缺氧等。
3、肝功能异常可出现胆道阻塞，如结石、肿瘤、蛔虫等使胆汁淤积，如时间过长，可因滞留的胆汁对肝细胞的损害作用和肝内扩张的胆管对血窦压迫造成肝缺血，引起肝细胞和坏死。
4、肝功能异常可导致出现遗传性疾病，有些遗传性疾病如血色病、囊性纤维化、a1-抗胰蛋白酶缺陷症、Wilson氏病等是最常见、最重要的先天性肝脏疾病，都是可能导致肝功能异常的原因。
