肝癌的诊断方法有许多，不过要确诊肝癌，最重要的要数AFP，不过只是单纯的检查出AFP的升高，并不能确诊为肝癌，这就需要其他的诊断方法。AFP是肝癌的肿瘤标志物，多数肝癌病人可出现AFP升高，原发性肝癌患者血清中AFP升高可达250ng—600mg/ml。但不是所有的AFP升高都可以诊断为肝癌。
其实，较重的肝炎和肝硬化患者AFP升高也比较常见。肝脏主要是供应能量的脏器，如果不能满足患者的能量消耗，肝脏必需快速新生肝细胞来补充必需要的数量。肝纤维化越重，炎症破坏越猛，新生的肝细胞越多越幼稚，这些幼稚的新生肝细胞就会产生AFP。
肝癌细胞是最最幼稚的原始肝细胞，产生的AFP会比其他肝病多许多，但小肝癌的AFP水平也可以不很高；重度活动性肝硬化的AFP也可以高到1000以上，单独一次AFP检查不容易确定是不是肝癌。
AFP阳性的数值也随病变的重度而升高，一般是肝癌比失代偿的肝硬化高；肝硬化失代偿的比代偿的高；肝硬化比肝炎要高。
因此，我们可以看出，AFP增高并不代表肝癌的出现，还要考虑肝脏的其他疾病，要确诊肝癌要借助影像学设备的诊断，如CT、PET-CT等等，只有多种证据才能确诊肝癌。
