肝囊肿对人体健康没有多大影响。Ｂ超或ＣＴ检查时有时发现的囊肿数量多 ，有时发现的少 ，那是因为检查设备的局限性或检查者的仔细程度不一样，少一个并不意味着好，多一个也不意味着变坏。肝囊肿不会恶变。至今未发现肝囊肿的形成与某些食物有关，因此肝囊肿患者不必忌口。也未发现做家务、运动、工作对肝囊肿生长有促进作用，因此肝囊肿患者不需要改变自己的生活习惯及工作环境，可以工作，可以运动，在生活上没什么要特别注意的地方。
肝囊肿多数无须特殊治疗。单个或多个囊肿，无临床症状者，应定期进行B超检查，囊肿超过5厘米者可考虑在超声引导下穿刺吸出囊液后注入硬化剂处理。平时应避免肝区被外力碰撞，以免囊肿破裂。有下列情况者应考虑特殊治疗：（1）巨大肝囊肿：少数肝囊肿生长较快，当直径超过10厘米时，称为巨大肝囊肿。巨大肝囊肿可引起压迫症状，影响生活和工作，应考虑进行治疗。（2）囊肿继发感染：肝囊肿一般很少继发感染，但少数肝囊肿可继发感染。这些患者可有肝区疼痛、发烧、血白细胞升高等炎症表现，B超检查可显示增厚的囊壁、液性暗区及混杂的增强光点(提示脓液)。对这些患者应及时治疗。（3）囊肿继发出血：少数肝囊肿的囊壁血管可自发破裂导致囊内出血，有的无明显症状，有的肝区剧烈疼痛，如保守治疗无效应手术治疗。（4）囊肿扭转：悬垂型囊肿扭转时会产生剧烈疼痛，手术可能是唯一的治疗方法。
