1．尿、粪检查
尿胆红素阳性或强阳性，尿胆元减少或缺如。粪胆元减少或缺如。粪便中脂肪酸及脂肪酸钙增多。
2．肝功能试验
（1）血清胆红素 血清胆红素含量增高，以直应性胆红素（结合胆红素）升高为主。
（2）碱性磷酸酶与γ-谷氨酰转肽酶 PBC早期，黄疸尚未出现时，即可有碱性磷酸酶（ALP）和γ-谷氨酰转肽酶（GGT）的增高，其中以ALP增高较明显，黄疸出现后升高更著。ALP在黄疸出现前即升高的现象有助于本病的早期诊断。
（3）总胆固醇 60 % 患者血清胆固醇升高；但在本病晚期出现肝功能衰竭时，血清胆固醇可降低。
（4）血清蛋白 PBC的早期，血清蛋白可无明显改变。至病程晚期，肝功能严重受损时，出现血清白蛋白降低、球蛋白升高，白、球蛋白比值下降，甚至倒置。血清蛋白电泳分析显示，α2、β球蛋白增高，γ球蛋白正常或中度增高。
（5）血清转氨酶 早期正常或仅轻度升高；晚期肝细胞损害明显时，转氨酶活力相应升高。
（6）血浆凝血酶原时间及活动度 由于维生素K缺乏，凝血酶原时间常延长，活动度降低，但给予维生素K注射，可使之恢复正常。晚期因肝功能衰竭所致凝血障碍，注射维生素K无效。
3．血清脂质
患者甘油三脂略高。在病程早期，高密度脂蛋白（HDL）明显升高，低密度脂蛋白（LDL）和极低密度脂蛋白（VLDL）轻度升高；晚期则以LDL升高为主，HDL降低。血清胆固醇如前所述。
4．免疫学检查
（1）自身抗体 由PBC患者的血清中可检出ANA、SMA、AMA、抗中性粒细胞胞浆抗体（ANCA）、抗胆小管上皮抗体等，其中以AMA最为重要。约90 % 以上的PBC患者AMA阳性，且出现早，滴度很高，为本病的特征性改变，具有诊断价值。在AMA中，又以抗AMA-M2成分最具特异性。此外，亦可检测到抗AMA-M4、M8、M9等成分。
（2）免疫球蛋白及补体 血清IgM可明显升高，IgA及IgG正常或增高。总补体轻度升高，C4明显降低，其余各补体成分大多轻度升高。
（3）非特异性细胞免疫试验 PBC患者的非特异性细胞免疫试验常显示其细胞免疫功能降低。
5．肝穿刺活组织检查
可发现胆管炎、汇管区淋巴细胞局灶性浸润及肉芽肿、“胆管型”纤维化、汇管区周围胆汁淤积、轻度碎屑样坏死等改变，但肝小叶常完整。
6．内窥镜下逆行胆管造影
可发现肝内胆管蜿蜒曲折或管腔不规则。
7．腹腔镜检查
第一期，肝脏外观呈黄红色；第二期，肝脏黄红色加深，动脉血管和淋巴管显著，有肉芽肿形成；第三期，肝表面呈颗粒状小结节，有门脉高压征象；第四期，肝外观呈深绿色，表面呈较大结节状，有门脉高压征象。原发性胆汁性肝硬化诊断和鉴别诊断
中年女性，主诉不明原因的皮肤瘙痒、乏力，长期阻塞性黄疸持续或反复发作，伴皮肤黄疣、肝脏肿大，可有肝硬化表现；实验室检查，ALP及IgM明显增高，总胆固醇升高，AMA呈强阳性，细胞免疫功能低下，即应考虑PBC的诊断。肝穿刺活组织检查可确诊。胆道造影检查可除外肝外胆道梗阻。在早期无症状患者血清中检出AMA，对早期诊断有重要价值。
PBC应与继发性胆汁性肝硬化、原发性硬化性胆管炎（PSC）、AIH、药物性肝内胆汁淤积等疾病相鉴别。
