感染hcv后若没有及时发现和正确治疗，约80%以上的病人会发展为慢性丙肝。大多数病情进展缓慢，可持续10～20年以上，不易被病人觉察。其中一部分病人会发展成肝硬化，少数进一步演变成肝癌。因此，急性和慢性丙肝患者均应积极治疗，以控制病情的发展。
首先，要适当休息、合理营养和饮食、禁忌饮酒、合理使用保肝药等，这是所有病毒性肝炎的共同疗法。其次，应尽早进行抗病毒治疗，与治疗乙肝一样，抗病毒治疗也是丙肝治疗的关键。急性丙肝早期进行抗病毒治疗，能有利于防止发展为慢性丙肝。慢性丙肝经过抗病毒治疗后，能抑制病毒复制，减轻肝内炎症和纤维化，延缓或阻断病情发展为肝硬化、肝癌和肝衰竭。
目前用于丙肝抗病毒治疗的唯一有效的药物是α干扰素。临床上广泛使用的主要是重组人干扰素α1b、α2a和α2b。我国自行研制、生产的α1b干扰素，其疗效与国外进口干扰素相同，α1b干扰素已经在我国临床上广泛使用。
丙肝病毒感染者，如果血清hcv-rna阳性或抗-hcv 阳性，同时血清alt升高（除其他原因外）或肝穿证实肝组织有明显炎症，都应该尽早使用α干扰素治疗。α干扰素一般每次30～50微克（α1b干扰素），或300万单位（α2干扰素），第一个月每日一次，以后隔日一次，皮下或肌肉注射。急性丙肝疗程为12周，慢性丙肝疗程为12个月。根据病情需要可延长疗程。在选好适应证的情况下，也可以采用联合疗法，联合治疗可以提高疗效。最常见的是联合病毒唑治疗，在使用α干扰素治疗的同时，每日口服病毒唑1000～1200mg，疗程6～12个月。
由于目前还没有可靠的丙肝疫苗可用，加强自我保护显得非常重要。在非必要情况下，尽量减少输血和使用血制品；避免接触可能为丙肝病毒污染的血液和其他体液，必须接触时要戴上手套；不与别人共用注射器、牙刷、剃刀等；在就诊或美容时使用彻底消毒的器具；避免不洁性行为或提倡使用安全套等。另外，已感染hcv者就诊牙医或其他检查时，应向医师告知病情，以采取适当的防护措施；已感染者不得作为供血员。
