由于肝癌的非移植治疗（包括手术治疗、介入治疗、化学治疗、免疫治疗和中西医结合治疗）已获得了满意的疗效，手术风险和医疗花费也远比肝移植小得多，加之，其并发症的处理也比肝移植术后并发症的处理更容易，所以，原则上，肝癌患者选择肝移植应当非常慎重。
传染病专家指出，肝移植作为终末期肝病的有效治疗手段，已经得到内科医师、患者的认可和社会的接受，但国内肝移植目前面临一些迫切需要解决的问题。
第一，肝癌及肝胆系统其他恶性肿瘤的肝移植亟需规范化。原发性肝癌绝大多数是不可切除之大肝癌，肝内外门静脉系统中已经有癌栓者占国内肝移植患者1/3，甚至50％以上。移植后不管怎样积极治疗，一年内复发率可达80％，三年生存率<30％。最快可在术后两个月之内即广泛播散，为晚期肝癌尤其是门静脉大分支内有癌栓者做肝移植，极大地浪费了有限的供肝来源和社会资源。
第二，乙肝病毒感染复发及再感染（来自供肝）是妨碍肝移植术后中长期生存率提高的重要因素。应加强术前积极的抗病毒治疗，术后规范的、长期的联合应用拉米呋定抗乙肝免疫球蛋白治疗和监测，也应完善对供体乙肝病毒感染的检测。
第三，活动性乙肝病毒感染者，移植术后肝炎复发率可达90％，移植前后如不加有效治疗，是导致患者移植后迅速发生肝硬化（两年之内）及死亡的最主要原因。同时，术后胆道、血管并发症的有效预防和治疗，是提高肝移植术后中长期生存率的关键。
