在肝脏中，胆道系统与肝实质细胞是两个主要组成部分，两者间的既独立又密切关系和互相的影响，构成肝胆疾病时的错综复杂图像。
肝移植术在二十世纪九十年代的迅速发展，亦激励肝脏和胆道外科技术上的迅速发展。胆道系统是肝脏的重要构成，并且胆道系统似乎比肝细胞更“娇贵”，因它是独一无二的，没有像肝内血管那样的侧支循环，亦不像肝细胞那样具有强盛的再生能力。流通作为胆道的主要功能（虽然不是唯一的功能），胆管的梗阻、狭窄、闭塞必将造成肝细胞的损害和最终的肝功能衰渴。
一些原发性的胆管疾病如先天性胆道闭锁、原发性胆汁性肝硬化、原发性硬化性胆管炎等，已经成为肝移植术时的典型的手术指征，然而，此外尚有更多的继发性的胆管疾病发展至终末期，同样需要施行肝移植才能有效地挽救患者的生命。
然而肝移植术的常见而严重的并发症却发生在胆管系统，因而加深对胆道疾病的病理生理学上的了解有其重要意义。肝内胆管结石病虽然在人群中的发病率有所降低，而且在疾病的模式上有所改变，但肝脏内弥漫性病变和合并肝硬化、门静脉高压、终末期肝胆病变者的数量并不少，肝移植术在这些病人群体中，可能是唯一出路。
此外，尚有原发或继发的硬化性胆管炎、损伤性胆管狭窄常规治疗中的失败者、肝外科治疗中肝内胆管的损毁性病变、弥漫型的肝内胆管囊肿，均将成为肝移植治疗的对象。
原位肝移植术的后期失败，除了免疫排斥外，主要的是与胆道并发症有关，包括免疫学的和技术上的，所以胆道外科的问题成为肝移植中的Achilles heel，而历年来的许多技术上的改变都是围绕着胆管吻合方式，看来胆管并不像血管那样的“驯服”。
肝移植术中胆道外科的发展由胆肠吻合而趋于胆管吻合，包括活体肝移植。当前活体肝移植和减积肝移植的发展，向外科提出了更多的肝内胆管的解剖学和生理学研究的要求。
