一般来说患病时间短，无临床症状，肝功、血脂基本正常，仅B超提示有轻度脂肪肝者，可以通过戒酒、调整饮食、适量运动等方法治疗，大部分可自行恢复。如果不是这样，就应该去医院进行积极治疗。
第一，诊断明确。包括西医诊断中脂肪肝的分类、分期、分型、分度和中医诊断中的辨证分型。诊断不明确就抓不住主要矛盾，就不能做到“急治标，缓治本，标本兼治”，也发挥不出“整合疗法”的优势，影响治疗效果，因此要西医诊断与中医辨证相结合。
第二，治疗方案随证变化。脂肪肝是一种病理状态相对固定，但治疗中的“证型”又不断变化的疾病，因此治疗法则应相对灵活。常用的治疗法则有疏肝、利胆、健脾、和胃、补肾、活血、理气、化痰、利湿、清热，这些治则要根据患者的不同和疾病所处阶段的不同，抓住主要矛盾，结合HD肝病治疗仪的经络、穴位治疗，药物导入治疗及口服中西药物治疗，并与食疗、体疗有机整合，制订出最佳的治疗方案。
第三，综合判定疗效。治疗前后要从影像学变化（B超或CT）、血生化指标（肝功、血脂）、症状体征三项指标来考虑。一般只要有一项指标有明显改善，其他两项也会改善，有时临床表现不同步。
第四，合理应用肝病治疗仪。运用肝病治疗仪时，针对不同的病人，需要采用不同的强度、配穴、导入药方及体位、循经手法，这在临床上很有讲究，应因人因病施治。医生应认真与患者沟通，并作好记录，经过一周左右的时间，找出针对该患者的最佳组合方案。
第五，患者积极配合。脂肪肝治疗须医患密切配合，戒酒、改变不良生活习惯及饮食习惯，这对提高临床疗效关系重大。门诊治疗无法控制患者的饮食，如患者配合不好疗效会大打折扣。
第六，坚持治疗。因脂肪肝就医的患者大部分是在职人员，由于各种原因坚持治疗有困难。此时可利用家用型肝病仪在家治疗，定期复查。医生要帮助患者克服急于求成的心理。
第七，注意个体差异。一般仪器治疗得气感强的患者疗效较好，迟钝型或敏感型体质患者疗效较差。中青年患者疗效较好，老年患者疗效较差。单纯性脂肪肝患者疗效较好，合并有糖尿病、高血压、肾病等慢性病患者疗效较差。有家族聚集史的患者疗效较差。
