对于脂肪肝症状较重者，应辅以适当的药物治疗。目前临床使用的药物主要有保肝类药物如水飞蓟宾(水林佳)，抗氧化剂类药物如还原型谷光甘肽、VE等，具有一定的降酶保肝作用，并可减少诱发的肝纤维化。另外，中药大、小柴胡汤对脂肪肝也有一定疗效。
对于降脂药，虽部分药物能有效降低血脂，却难以清除肝脏中沉积的脂肪，且长期大剂量服用极易发生肝毒性。因此，不伴有高脂血症的脂肪肝患者，可以不用降血脂药物；酒精性脂肪肝伴高脂血症，首先戒酒，一般无需应用降血脂药；肥胖症、糖尿病性脂肪肝伴有高脂血症者，经控制饮食、增加运动血脂仍持续异常者，应谨慎选用降血脂药物，同时监测肝肾功能，必要时联用保肝药物。
